15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1358 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1358  hypothetical protein  100 
 
 		 43 aa  93.6  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3555  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  50 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4812  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  50 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5471  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  50 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0406777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0891  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  51.35 
 
 		 239 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138427  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0533  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  77.27 
 
 		 267 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.116502  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2196  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  64.29 
 
 		 214 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1324  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  52.94 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.557564  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2367  hypothetical protein  51.28 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2514  hypothetical protein  51.28 
 
 		 226 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10061  D-ala-D-ala dipeptidase  46.81 
 
 		 244 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.331576  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22940  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  53.57 
 
 		 248 aa  41.2  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0161  D-ala-D-ala dipeptidase  53.85 
 
 		 251 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.834383  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16701  D-ala-D-ala dipeptidase  58.33 
 
 		 252 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.846415 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07931  D-ala-D-ala dipeptidase  53.85 
 
 		 251 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>