84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16701 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_16701  D-ala-D-ala dipeptidase  100 
 
 		 252 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.846415 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1243  D-ala-D-ala dipeptidase  63.04 
 
 		 236 aa  295  5e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10061  D-ala-D-ala dipeptidase  55 
 
 		 244 aa  288  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.331576  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1226  putative D-alanyl-D-alanine dipeptidase  60.87 
 
 		 233 aa  284  8e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.101046  normal  0.395432 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07931  D-ala-D-ala dipeptidase  55.17 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0161  D-ala-D-ala dipeptidase  55.17 
 
 		 251 aa  261  6e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.834383  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1425  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  46.19 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1391  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  45.76 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2224  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  46.22 
 
 		 237 aa  208  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0765  D-ala-D-ala dipeptidase  43.22 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.667505  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0787  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  47.01 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4557  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  45.98 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08171  D-ala-D-ala dipeptidase  42.06 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4490  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  45.81 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0087  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  44.14 
 
 		 231 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0432  D-alanyl-D-alanine dipeptidase-like  43.29 
 
 		 232 aa  171  9e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.34989  normal  0.285253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0462  d-alanyl-d-alanine dipeptidase, putative  43.09 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.528345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0622  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  43.09 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39780  D-ala-D-ala dipeptidase  40.79 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384514  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3149  putative D-alanyl-d-alanine dipeptidase  36.74 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00328956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1333  peptidase M15D, VanX D-ala-D-ala dipeptidase  35.27 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0663  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  35.68 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15160  hypothetical protein  34.38 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803712  hitchhiker  0.0000117372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2448  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  34.05 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0214  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.33 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0532719  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1551  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  34.57 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03946  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2367  hypothetical protein  31 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2514  hypothetical protein  30.13 
 
 		 226 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0891  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  32.65 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138427  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2196  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  31.75 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0533  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.74 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.116502  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3555  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.05 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5471  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.05 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0406777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4812  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.05 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1324  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.38 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.557564  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22940  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.63 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2827  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.81 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1654  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  29.14 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.52906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4461  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  31.58 
 
 		 244 aa  62  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11948  probable peptidase  41.25 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3562  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  37.65 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25870  D-Ala-D-Ala dipeptidase vanX  36.9 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1441  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.9 
 
 		 189 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.494405  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4003  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  38.46 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4116  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  37.65 
 
 		 190 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53772  normal  0.253468 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2133  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  24.58 
 
 		 200 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0344  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.93 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0077  D-Ala-D-Ala dipeptidase  38.1 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.033757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4601  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  32.56 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2018  peptidase M15D VanX D-ala-D-ala dipeptidase  31.67 
 
 		 174 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.538777  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6300  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  37.18 
 
 		 187 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2615  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  34.82 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1661  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  37.5 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1273  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.9 
 
 		 189 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327296  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1393  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.9 
 
 		 189 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0694639  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1312  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.9 
 
 		 189 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.506503  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1051  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.9 
 
 		 189 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1272  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.31 
 
 		 216 aa  48.5  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0517  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.9 
 
 		 189 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0246  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.9 
 
 		 189 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620144  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1343  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.71 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2563  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.9 
 
 		 189 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0198  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  38.46 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0693761 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1785  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  39.74 
 
 		 187 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2346  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.9 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3762  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  37.21 
 
 		 190 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.553521  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0835  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  38.46 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0247724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0800  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  38.75 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0574053  normal  0.256235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0840  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  38.75 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.593673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1410  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  33.33 
 
 		 327 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2451  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  38.64 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2745  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  25.13 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1902  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  31.45 
 
 		 404 aa  45.8  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1685  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  34.88 
 
 		 193 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7136  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  35.71 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0522  D-Ala-D-Ala dipeptidase  27.08 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4478  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.33 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129576  normal  0.531812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5357  D-Ala-D-Ala dipeptidase  36.9 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395884  normal  0.146315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4285  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.76 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04244  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  26.37 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0763  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  36.25 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.0376933 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1751  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.72 
 
 		 193 aa  42.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4059  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.05 
 
 		 187 aa  42.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1415  D-Ala-D-Ala dipeptidase  29.76 
 
 		 213 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>