76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22940 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_22940  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  100 
 
 		 248 aa  494  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39780  D-ala-D-ala dipeptidase  40.64 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384514  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0663  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  38.22 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15160  hypothetical protein  38.74 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803712  hitchhiker  0.0000117372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1333  peptidase M15D, VanX D-ala-D-ala dipeptidase  37.97 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2196  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.93 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3149  putative D-alanyl-d-alanine dipeptidase  35.98 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00328956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16701  D-ala-D-ala dipeptidase  33.68 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.846415 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1324  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.73 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.557564  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0214  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.16 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0532719  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1243  D-ala-D-ala dipeptidase  34.59 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0891  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  34.59 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138427  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1226  putative D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.48 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.101046  normal  0.395432 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4812  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  34.09 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5471  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  34.09 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0406777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3555  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  34.09 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2448  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.68 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1551  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.84 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03946  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10061  D-ala-D-ala dipeptidase  30.22 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.331576  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0161  D-ala-D-ala dipeptidase  32 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.834383  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07931  D-ala-D-ala dipeptidase  31.43 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0765  D-ala-D-ala dipeptidase  29.83 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.667505  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0533  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.24 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.116502  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08171  D-ala-D-ala dipeptidase  30.94 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4601  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.76 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2224  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.77 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2615  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  31.25 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1391  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.5 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4285  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  32.24 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1343  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.06 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1425  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0432  D-alanyl-D-alanine dipeptidase-like  31.79 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.34989  normal  0.285253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1987  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.46 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2367  hypothetical protein  29.17 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2514  hypothetical protein  27.98 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2745  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0087  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.27 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0787  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.04 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4557  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  26.23 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0763  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  31.48 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.0376933 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1272  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  31.58 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4461  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  32 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0800  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.25 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0574053  normal  0.256235 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1902  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  32.68 
 
 		 404 aa  53.9  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11948  probable peptidase  35.87 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2827  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.68 
 
 		 231 aa  52.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2133  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.08 
 
 		 200 aa  52.4  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0840  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.63 
 
 		 220 aa  52  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.593673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4490  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.34 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0344  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  26.26 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1410  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.62 
 
 		 327 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4116  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.72 
 
 		 190 aa  49.7  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53772  normal  0.253468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1661  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.57 
 
 		 202 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1415  D-Ala-D-Ala dipeptidase  31.65 
 
 		 213 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2426  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  25.41 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0429393 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0077  D-Ala-D-Ala dipeptidase  28.48 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.033757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4478  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129576  normal  0.531812 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5715  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0449743 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4590  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.977073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3778  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1654  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  31.11 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.52906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3026  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  25.62 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4016  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0835  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  31.45 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0247724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5357  D-Ala-D-Ala dipeptidase  30.86 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395884  normal  0.146315 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1685  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.1 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0462  d-alanyl-d-alanine dipeptidase, putative  33.68 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.528345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0622  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  33.68 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0653  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.68 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1254  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  29.53 
 
 		 187 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4059  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  29.6 
 
 		 187 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3562  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  31.29 
 
 		 200 aa  42.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2346  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.92 
 
 		 187 aa  42.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1206  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  26.67 
 
 		 227 aa  42  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1358  hypothetical protein  53.57 
 
 		 43 aa  42  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0509  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.91 
 
 		 234 aa  42  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>