98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_08171 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_08171  D-ala-D-ala dipeptidase  100 
 
 
227 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0765  D-ala-D-ala dipeptidase  88.11 
 
 
227 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.667505  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10061  D-ala-D-ala dipeptidase  45.92 
 
 
244 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.331576  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1226  putative D-alanyl-D-alanine dipeptidase  40.97 
 
 
233 aa  204  9e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.101046  normal  0.395432 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16701  D-ala-D-ala dipeptidase  42.06 
 
 
252 aa  197  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.846415 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1243  D-ala-D-ala dipeptidase  39.47 
 
 
236 aa  192  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0787  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  41.48 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209918 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07931  D-ala-D-ala dipeptidase  38.96 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0161  D-ala-D-ala dipeptidase  38.53 
 
 
251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.834383  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1425  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  37.99 
 
 
233 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511324  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1391  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  37.99 
 
 
233 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0432  D-alanyl-D-alanine dipeptidase-like  39.91 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.34989  normal  0.285253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4490  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  35.54 
 
 
242 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2224  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  38.4 
 
 
237 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4557  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  35.32 
 
 
240 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0087  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  36.17 
 
 
231 aa  156  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0622  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  36.6 
 
 
273 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0462  d-alanyl-d-alanine dipeptidase, putative  36.6 
 
 
263 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.528345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39780  D-ala-D-ala dipeptidase  31.84 
 
 
254 aa  125  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384514  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0663  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  33.63 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1333  peptidase M15D, VanX D-ala-D-ala dipeptidase  32.13 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15160  hypothetical protein  30.7 
 
 
235 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803712  hitchhiker  0.0000117372 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0214  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.13 
 
 
244 aa  105  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0532719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2448  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.82 
 
 
251 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3149  putative D-alanyl-d-alanine dipeptidase  31.05 
 
 
270 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00328956  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2514  hypothetical protein  34.2 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2367  hypothetical protein  33.77 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2196  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  23.53 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348263  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1551  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.81 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03946  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3555  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  24.32 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4812  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  24.32 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5471  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  24.32 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0406777 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1324  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.87 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.557564  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0891  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  24.32 
 
 
239 aa  72  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138427  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0533  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.65 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.116502  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22940  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  29.63 
 
 
248 aa  62  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1685  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.16 
 
 
193 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2827  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.72 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159647  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2169  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  26.54 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.159114  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01446  D-ala-D-ala dipeptidase, Zn-dependent  26.54 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2100  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  26.54 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01458  hypothetical protein  26.54 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1677  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  26.54 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2159  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  26.54 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00101458  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1751  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  26.54 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1272  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.4 
 
 
216 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1410  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  35.78 
 
 
327 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2745  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  25.84 
 
 
237 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791278  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1654  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  26.95 
 
 
207 aa  55.1  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.52906 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2018  peptidase M15D VanX D-ala-D-ala dipeptidase  32.76 
 
 
174 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.538777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1573  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  25.93 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2346  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.66 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2615  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.38 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3562  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.79 
 
 
200 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271159  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4601  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.33 
 
 
225 aa  52.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1902  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.03 
 
 
404 aa  51.6  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4059  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.97 
 
 
187 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4116  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  33.33 
 
 
190 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53772  normal  0.253468 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1254  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.28 
 
 
187 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1415  D-Ala-D-Ala dipeptidase  28.08 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3762  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.22 
 
 
190 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.553521  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0835  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  26.09 
 
 
263 aa  49.7  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0247724 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1627  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.3 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11948  probable peptidase  27.16 
 
 
196 aa  49.3  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4478  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  26.21 
 
 
187 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129576  normal  0.531812 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2119  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.95 
 
 
222 aa  48.5  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1393  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.76 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0694639  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1273  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.76 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1312  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.76 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.506503  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0517  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.76 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1051  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.76 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2563  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.76 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1343  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  26.04 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0246  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.76 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620144  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4590  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  26.21 
 
 
187 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.977073  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2133  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  24.69 
 
 
200 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5715  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  26.21 
 
 
187 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0449743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3778  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  26.21 
 
 
187 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4016  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  26.21 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568092  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1206  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.77 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6300  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  36.49 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0198  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  26.24 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0693761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0763  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  35.53 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.0376933 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1441  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.78 
 
 
189 aa  45.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.494405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4461  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.76 
 
 
244 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5357  D-Ala-D-Ala dipeptidase  26.21 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395884  normal  0.146315 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0077  D-Ala-D-Ala dipeptidase  23.29 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.033757  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4003  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.78 
 
 
188 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1661  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.08 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5181  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  32.43 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.242688 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2638  hypothetical protein  22.11 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1987  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  26.17 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5792  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  23.29 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4285  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.49 
 
 
226 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1575  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  37.33 
 
 
205 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169844  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1785  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  25.3 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000113929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0800  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  33.77 
 
 
220 aa  42  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0574053  normal  0.256235 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25870  D-Ala-D-Ala dipeptidase vanX  27.22 
 
 
254 aa  41.6  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>