98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1226 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1226  putative D-alanyl-D-alanine dipeptidase  100 
 
 
233 aa  473  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.101046  normal  0.395432 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1243  D-ala-D-ala dipeptidase  60 
 
 
236 aa  287  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16701  D-ala-D-ala dipeptidase  60.87 
 
 
252 aa  284  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.846415 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10061  D-ala-D-ala dipeptidase  50 
 
 
244 aa  252  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.331576  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0161  D-ala-D-ala dipeptidase  50.43 
 
 
251 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.834383  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07931  D-ala-D-ala dipeptidase  50 
 
 
251 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2224  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  45.49 
 
 
237 aa  214  9e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08171  D-ala-D-ala dipeptidase  40.97 
 
 
227 aa  204  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0765  D-ala-D-ala dipeptidase  40.09 
 
 
227 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.667505  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1425  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  42.61 
 
 
233 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511324  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1391  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  42.17 
 
 
233 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4557  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  45.16 
 
 
240 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0787  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  45.65 
 
 
234 aa  195  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209918 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0432  D-alanyl-D-alanine dipeptidase-like  48 
 
 
232 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.34989  normal  0.285253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4490  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  43.81 
 
 
242 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0087  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  46.08 
 
 
231 aa  188  7e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0462  d-alanyl-d-alanine dipeptidase, putative  43.32 
 
 
263 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.528345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0622  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  43.32 
 
 
273 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39780  D-ala-D-ala dipeptidase  38.91 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384514  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3149  putative D-alanyl-d-alanine dipeptidase  35.56 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00328956  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0663  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  36.68 
 
 
253 aa  101  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2196  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.42 
 
 
214 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348263  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15160  hypothetical protein  34.25 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803712  hitchhiker  0.0000117372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1333  peptidase M15D, VanX D-ala-D-ala dipeptidase  33.19 
 
 
253 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2448  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.61 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1324  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.63 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.557564  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0214  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.96 
 
 
244 aa  89.7  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0532719  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2514  hypothetical protein  27.43 
 
 
226 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1551  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.26 
 
 
252 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03946  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2367  hypothetical protein  27.75 
 
 
226 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4812  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  33.16 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5471  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  33.16 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0406777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3555  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  33.16 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0891  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  33.52 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138427  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0533  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.88 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.116502  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22940  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.48 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2827  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.38 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159647  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4116  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  34.72 
 
 
190 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53772  normal  0.253468 
 
 
-
 
NC_002950  PG1654  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  29.19 
 
 
207 aa  62.4  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.52906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3562  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  36.21 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271159  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0198  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.17 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0693761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4601  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  26.09 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6300  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.79 
 
 
187 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4059  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  36.5 
 
 
187 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0835  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  40.54 
 
 
263 aa  58.9  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0247724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1441  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.97 
 
 
189 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.494405  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4003  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.64 
 
 
188 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1254  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.77 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1785  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  36.59 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000113929 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2563  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.81 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1051  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.81 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1312  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.81 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.506503  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1393  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.81 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0694639  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0517  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.81 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0246  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.81 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620144  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1273  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.81 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327296  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4590  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  34.31 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.977073  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3778  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  34.31 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5715  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  34.31 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0449743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1661  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  42.86 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4461  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.08 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1343  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.24 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2745  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.17 
 
 
237 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791278  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4478  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.04 
 
 
187 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129576  normal  0.531812 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4016  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.04 
 
 
187 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568092  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1902  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.82 
 
 
404 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1272  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.52 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2133  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  25.47 
 
 
200 aa  52.8  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2018  peptidase M15D VanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.01 
 
 
174 aa  52.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.538777  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0344  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  31.71 
 
 
237 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1685  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  31.65 
 
 
193 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1987  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  33.13 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2615  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.76 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11948  probable peptidase  28.83 
 
 
196 aa  49.7  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25870  D-Ala-D-Ala dipeptidase vanX  33.75 
 
 
254 aa  48.9  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7136  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  38.75 
 
 
216 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165189  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0509  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  31.33 
 
 
234 aa  48.5  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3762  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  38.1 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.553521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0522  D-Ala-D-Ala dipeptidase  41.18 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1410  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  33.7 
 
 
327 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1751  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.22 
 
 
193 aa  45.8  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5357  D-Ala-D-Ala dipeptidase  36.25 
 
 
202 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395884  normal  0.146315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1415  D-Ala-D-Ala dipeptidase  33.75 
 
 
213 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2100  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.22 
 
 
193 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2159  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.22 
 
 
193 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00101458  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1677  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.22 
 
 
193 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01446  D-ala-D-ala dipeptidase, Zn-dependent  30.22 
 
 
193 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2169  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.22 
 
 
193 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.159114  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01458  hypothetical protein  30.22 
 
 
193 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2346  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  34.57 
 
 
187 aa  45.4  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04244  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.77 
 
 
248 aa  45.4  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0763  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.5 
 
 
224 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.0376933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2451  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.14 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1573  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  29.5 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0077  D-Ala-D-Ala dipeptidase  30 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.033757  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5792  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  37.5 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0800  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  35.06 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0574053  normal  0.256235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0840  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  35.06 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.593673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>