96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0462 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0622  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  100 
 
 		 273 aa  537  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0462  d-alanyl-d-alanine dipeptidase, putative  100 
 
 		 263 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.528345  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1425  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  48.13 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1391  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  47.72 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4557  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  45.27 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0432  D-alanyl-D-alanine dipeptidase-like  44.49 
 
 		 232 aa  195  6e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.34989  normal  0.285253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2224  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  42.91 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4490  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  43.87 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0787  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  43.8 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209918 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10061  D-ala-D-ala dipeptidase  41.13 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.331576  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16701  D-ala-D-ala dipeptidase  43.09 
 
 		 252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.846415 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1226  putative D-alanyl-D-alanine dipeptidase  43.32 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.101046  normal  0.395432 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07931  D-ala-D-ala dipeptidase  43.03 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0087  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  42.11 
 
 		 231 aa  176  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0161  D-ala-D-ala dipeptidase  43.03 
 
 		 251 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.834383  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1243  D-ala-D-ala dipeptidase  42.15 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0765  D-ala-D-ala dipeptidase  37.71 
 
 		 227 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.667505  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08171  D-ala-D-ala dipeptidase  36.6 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0214  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.13 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0532719  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2514  hypothetical protein  29.17 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2367  hypothetical protein  28.99 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15160  hypothetical protein  32.52 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803712  hitchhiker  0.0000117372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39780  D-ala-D-ala dipeptidase  33.05 
 
 		 254 aa  92  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384514  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3149  putative D-alanyl-d-alanine dipeptidase  36.41 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00328956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2448  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27 
 
 		 251 aa  88.6  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1333  peptidase M15D, VanX D-ala-D-ala dipeptidase  31.71 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2196  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.16 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1551  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.58 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03946  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1324  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.69 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.557564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2827  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.85 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2133  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.92 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5471  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.34 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0406777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4812  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.34 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3555  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.34 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0891  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  31.25 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138427  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0663  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.92 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1902  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  32.69 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0533  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.25 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.116502  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4116  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  39.8 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53772  normal  0.253468 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0077  D-Ala-D-Ala dipeptidase  30.82 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.033757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1272  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.53 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6300  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  39.13 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0198  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.57 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0693761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2346  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.91 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1441  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  40.22 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.494405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4601  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  24.36 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1051  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  38.04 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1312  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  38.04 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.506503  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1393  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  38.04 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0694639  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0517  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  38.04 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2563  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  38.04 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1273  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  38.04 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327296  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0246  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  38.04 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620144  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1654  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  24.72 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.52906 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1254  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  40.22 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3762  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.77 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.553521  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2100  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.51 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01458  hypothetical protein  27.51 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1751  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.51 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2159  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.51 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00101458  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4003  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  34.78 
 
 		 188 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01446  D-ala-D-ala dipeptidase, Zn-dependent  27.51 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1677  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.51 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2169  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.51 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.159114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4590  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  39.13 
 
 		 187 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.977073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4478  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  40.22 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129576  normal  0.531812 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3778  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  39.13 
 
 		 187 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25870  D-Ala-D-Ala dipeptidase vanX  28.93 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1685  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.51 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0835  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  38.27 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0247724 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5715  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  39.13 
 
 		 187 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0449743 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3562  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  34.38 
 
 		 200 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1785  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  36.96 
 
 		 187 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113929 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4016  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  40.22 
 
 		 187 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4059  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  39.13 
 
 		 187 aa  52.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1573  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  26.98 
 
 		 193 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11948  probable peptidase  28.74 
 
 		 196 aa  52.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2615  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.64 
 
 		 212 aa  52  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1343  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  25.93 
 
 		 215 aa  52  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0344  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.57 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4461  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  32.14 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0800  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  35.9 
 
 		 220 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0574053  normal  0.256235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1987  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  35 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1661  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.26 
 
 		 202 aa  48.9  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4285  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  35.29 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0653  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.85 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0840  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  35.9 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.593673 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2451  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  38.37 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2745  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.01 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0763  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  31.03 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.0376933 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1627  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  26.29 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1575  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  37.23 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169844  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5181  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  34 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7136  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  33.33 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2119  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  25.95 
 
 		 222 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1206  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  35.06 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>