More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0469 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0469  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  157  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0493  hypothetical protein  97.4 
 
 
77 aa  157  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1685  cold-shock DNA-binding protein family protein  55.26 
 
 
89 aa  94  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000048024  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  62.12 
 
 
67 aa  94  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.287556  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  66.15 
 
 
66 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2376  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.5 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000357457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.38 
 
 
67 aa  90.5  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02364  stress response protein CspD  58.9 
 
 
72 aa  90.5  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000164326  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00885  cold shock protein-like protein  57.75 
 
 
74 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.679557  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2762  cold-shock DNA-binding domain protein  57.75 
 
 
74 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00553863  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1041  stationary phase/starvation inducible regulatory protein CspD  57.75 
 
 
74 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000029024  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0984  stationary phase/starvation inducible regulatory protein CspD  57.75 
 
 
74 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2694  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.15 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.251619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2449  stationary phase/starvation inducible regulatory protein CspD  57.75 
 
 
74 aa  89.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0782347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0953  stationary phase/starvation inducible regulatory protein CspD  57.75 
 
 
74 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00980817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2280  stationary phase/starvation inducible regulatory protein CspD  57.75 
 
 
74 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00002354  normal  0.0221589 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00891  hypothetical protein  57.75 
 
 
74 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.67802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1599  cold shock domain-containing protein CspD  59.15 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2609  cold shock domain-containing protein CspD  59.15 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2716  stationary phase/starvation inducible regulatory protein CspD  57.75 
 
 
74 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0978  cold shock domain protein CspD  57.75 
 
 
73 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0945  cold shock domain protein CspD  57.75 
 
 
73 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00738434  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1042  cold shock domain-containing protein CspD  57.75 
 
 
73 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1668  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.38 
 
 
67 aa  88.6  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000281076  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1011  cold shock domain-containing protein CspD  57.75 
 
 
73 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1061  cold shock domain protein CspD  57.75 
 
 
73 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.510663  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5764  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.92 
 
 
170 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008002 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1672  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.75 
 
 
73 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3392  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.38 
 
 
68 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1759  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.92 
 
 
103 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0751  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.61 
 
 
67 aa  88.2  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  57.58 
 
 
67 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0492  putative cold-shock DNA-binding domain protein  57.81 
 
 
67 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1397  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.75 
 
 
73 aa  87.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0666799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3615  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.56 
 
 
84 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00635954  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3167  cold-shock DNA-binding domain protein  59.09 
 
 
68 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493488  hitchhiker  0.00220171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0798  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.09 
 
 
68 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000106482  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1564  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 
68 aa  87.4  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0747165  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28290  cold shock protein, CspD  57.81 
 
 
92 aa  87  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.5 
 
 
66 aa  86.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  0.00000000000100442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.92 
 
 
67 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.81 
 
 
67 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  56.92 
 
 
69 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5798  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.22 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1884  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 
68 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104557  hitchhiker  0.000000642748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3414  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.09 
 
 
83 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0959818 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4361  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2534  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.81 
 
 
68 aa  85.5  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.629108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 
68 aa  85.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0238191  normal  0.0590257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2545  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.09 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242015  decreased coverage  0.000000000715587 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5852  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.09 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587256  normal  0.480668 
 
 
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  57.81 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  57.81 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  55.38 
 
 
67 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.81 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2395  cold-shock DNA-binding protein family protein  50 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.80282  normal  0.0844989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3262  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.67 
 
 
87 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103728 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4166  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.72 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745487  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1909  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.09 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083542  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.81 
 
 
68 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3900  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.878106  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  55.38 
 
 
67 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2520  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.09 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000000151269  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1823  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.81 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565643  normal  0.0615675 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3184  cold-shock domain-contain protein  58.21 
 
 
67 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0586  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 
67 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2791  cold-shock domain-contain protein  58.21 
 
 
67 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.827238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1750  cold-shock domain-contain protein  58.21 
 
 
67 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3609  cold shock transcription regulator protein  58.21 
 
 
67 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3622  cold-shock domain-contain protein  58.21 
 
 
67 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3598  CspE-related protein  58.21 
 
 
67 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.164204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2739  cold-shock DNA-binding domain protein  58.21 
 
 
68 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000080188  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2936  cold-shock domain-contain protein  58.21 
 
 
67 aa  84.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3711  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.94 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000509741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2585  cold shock domain-containing protein CspD  57.81 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30200  cold-shock protein CspD  57.81 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  56.92 
 
 
69 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  56.92 
 
 
69 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  56.92 
 
 
69 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0002  cold shock-like transcription regulator protein  57.81 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000106276  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0958  cold shock protein  57.58 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000117939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  56.92 
 
 
69 aa  84.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2156  cold-shock domain-contain protein  57.58 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000351487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1051  cold-shock domain-contain protein  57.58 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0574  cold-shock domain-contain protein  57.58 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000358394  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5581  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.73 
 
 
67 aa  84.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2279  cold-shock domain-contain protein  57.58 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000000750079  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5838  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.81 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284132  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2438  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.58 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000000180609  unclonable  0.0000000000176576 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1112  cold shock transcription regulator protein  57.58 
 
 
81 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170415  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  56.92 
 
 
69 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1449  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.81 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0761  cold-shock domain-contain protein  57.58 
 
 
81 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.00000000000025188  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0962  cold shock protein  57.58 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000153995  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3904  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.81 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1646  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.81 
 
 
68 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452654  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1721  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.81 
 
 
68 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000154262  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2256  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.81 
 
 
68 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2568  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.58 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000063088  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4464  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.81 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>