More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2001 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2001  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
201 aa  417  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0768208  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1925  methionine sulfoxide reductase B  98.71 
 
 
155 aa  319  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0476823  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03070  methionine sulfoxide reductase B  72.03 
 
 
154 aa  224  7e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0440  methionine sulfoxide reductase B  67.59 
 
 
155 aa  216  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3166  methionine sulfoxide reductase B  60.54 
 
 
163 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3401  methionine sulfoxide reductase B  62.31 
 
 
141 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2945  methionine-R-sulfoxide reductase  59.4 
 
 
141 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2558  methionine-R-sulfoxide reductase  59.4 
 
 
141 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0971304  normal  0.867883 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  52.31 
 
 
132 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  55.93 
 
 
159 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  52.5 
 
 
150 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  52.89 
 
 
133 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  53.78 
 
 
137 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  53.78 
 
 
137 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  53.78 
 
 
137 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  53.78 
 
 
137 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  53.78 
 
 
137 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  53.78 
 
 
137 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  53.78 
 
 
137 aa  138  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  53.78 
 
 
137 aa  138  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  52.99 
 
 
148 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  54.31 
 
 
136 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  52.14 
 
 
140 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  51.64 
 
 
140 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  51.26 
 
 
142 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  51.59 
 
 
137 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  55.75 
 
 
166 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  50 
 
 
134 aa  136  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  51.64 
 
 
140 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  52.1 
 
 
137 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  47.69 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  52.1 
 
 
137 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  52.1 
 
 
137 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  51.26 
 
 
137 aa  135  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  52.1 
 
 
137 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  52.1 
 
 
137 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  52.17 
 
 
147 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  49.17 
 
 
127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  51.72 
 
 
127 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  52.17 
 
 
135 aa  134  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  50.82 
 
 
171 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  51.69 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7118  methionine-R-sulfoxide reductase  49.23 
 
 
171 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  52.1 
 
 
136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  49.57 
 
 
131 aa  132  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
190 aa  132  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.645705  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  52.25 
 
 
142 aa  132  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  50.42 
 
 
137 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  52.94 
 
 
134 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2350  methionine sulfoxide reductase B  52.14 
 
 
137 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167897  normal  0.0377518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1986  methionine sulfoxide reductase B  52.14 
 
 
137 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000131447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2095  methionine sulfoxide reductase B  52.14 
 
 
137 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000449437  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  49.57 
 
 
131 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  51.33 
 
 
142 aa  131  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  45.67 
 
 
136 aa  131  7.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2727  methionine sulfoxide reductase B  50.44 
 
 
137 aa  130  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00340114  hitchhiker  0.000973633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  47.93 
 
 
131 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  51.33 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  48.41 
 
 
137 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  50.42 
 
 
131 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  52.59 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  49.12 
 
 
133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  47.24 
 
 
189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  47.62 
 
 
141 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  48.72 
 
 
131 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  46.15 
 
 
133 aa  129  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  51.3 
 
 
151 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  48.67 
 
 
142 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  49.15 
 
 
134 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  52.78 
 
 
137 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  49.15 
 
 
146 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  50.43 
 
 
133 aa  128  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  51.85 
 
 
138 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  47.33 
 
 
138 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  51.33 
 
 
159 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1966  methionine sulfoxide reductase B  46.51 
 
 
139 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0169175  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  47.33 
 
 
138 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  47.5 
 
 
131 aa  128  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2262  methionine sulfoxide reductase B  47.29 
 
 
139 aa  128  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00190122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  48.76 
 
 
131 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  49.57 
 
 
138 aa  127  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  50.42 
 
 
154 aa  127  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  43.88 
 
 
140 aa  127  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  47.11 
 
 
131 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  47.86 
 
 
135 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  46.92 
 
 
136 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  48.72 
 
 
131 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  49.56 
 
 
132 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  52.17 
 
 
138 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
174 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  52.17 
 
 
138 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  44.62 
 
 
137 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  44.14 
 
 
155 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  51.33 
 
 
135 aa  125  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  45.04 
 
 
148 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  50.85 
 
 
167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  49.59 
 
 
150 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1817  methionine sulfoxide reductase B  49.12 
 
 
154 aa  125  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  46.72 
 
 
165 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>