More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0374 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0374  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
483 aa  916    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.833635  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
457 aa  209  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0937198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3220  putative two-component sensor histidine kinase  37.71 
 
 
459 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379511  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
453 aa  200  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  29.81 
 
 
425 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  29.81 
 
 
425 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
473 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  39.18 
 
 
391 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  39.25 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
434 aa  173  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
494 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  42.11 
 
 
438 aa  170  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 
435 aa  170  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
480 aa  169  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 
443 aa  169  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  37.69 
 
 
479 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
444 aa  167  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 
451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
349 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  33.85 
 
 
440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
454 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
468 aa  164  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  39.86 
 
 
458 aa  163  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 
479 aa  163  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 
463 aa  162  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
440 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
440 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
451 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  38.21 
 
 
499 aa  161  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
428 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
440 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
428 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
438 aa  159  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 
428 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 
454 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  36.23 
 
 
474 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
456 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
460 aa  157  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  39.58 
 
 
358 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
440 aa  157  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
428 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  31.77 
 
 
469 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
453 aa  156  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
485 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2145  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
469 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
462 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
717 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.37 
 
 
396 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
440 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  33.33 
 
 
454 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  38.3 
 
 
444 aa  154  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
442 aa  154  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
466 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  36.57 
 
 
344 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
462 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1473  putative osmolarity sensor protein EnvZ  36.24 
 
 
416 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0547648  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
442 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  38.38 
 
 
276 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1522  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  36.24 
 
 
432 aa  152  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
488 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
488 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
462 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
447 aa  152  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291283  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
469 aa  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
330 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
442 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0990  sensor histidine kinase  35.06 
 
 
446 aa  150  6e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0170043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
476 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 
439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.486419  normal  0.695508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  35.45 
 
 
344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2246  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
472 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175843  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
453 aa  148  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3010  histidine kinase  34.91 
 
 
458 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2353  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.657028  normal  0.419056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0993  two-component sensor  32.97 
 
 
434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
443 aa  147  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  37.93 
 
 
435 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
462 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
450 aa  147  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  36.47 
 
 
440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
469 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2747  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
458 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618913  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  38.16 
 
 
483 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
472 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
468 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
488 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  38.38 
 
 
468 aa  144  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>