More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3782 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010580  Bind_3782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
461 aa  913    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3220  putative two-component sensor histidine kinase  51.75 
 
 
459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379511  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0374  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
483 aa  202  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.833635  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
457 aa  177  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0937198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
479 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
468 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
444 aa  156  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
485 aa  157  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
434 aa  156  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
435 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
428 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 
428 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
469 aa  151  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
349 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  28.6 
 
 
479 aa  149  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
462 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
464 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  33.79 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  35.84 
 
 
499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
494 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
488 aa  146  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
488 aa  146  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  31.17 
 
 
440 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 
462 aa  146  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
480 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  36.74 
 
 
435 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
441 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  32.2 
 
 
391 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
462 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0993  two-component sensor  31.31 
 
 
434 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
430 aa  144  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
493 aa  144  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  28.73 
 
 
472 aa  144  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
440 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
440 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
462 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
441 aa  143  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
472 aa  141  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
456 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
443 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  35.66 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
473 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  27.65 
 
 
468 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
474 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
479 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000106108  normal  0.933142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  35.47 
 
 
468 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  33.72 
 
 
344 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
443 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  33.46 
 
 
344 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 
469 aa  139  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  27.43 
 
 
468 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  33.46 
 
 
425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
717 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
473 aa  138  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
440 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  33.46 
 
 
425 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
466 aa  137  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
477 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
468 aa  136  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
493 aa  136  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.486419  normal  0.695508 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  34.95 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
439 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  33.97 
 
 
432 aa  133  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
440 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
453 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
453 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
488 aa  133  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
460 aa  133  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  34.59 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.59 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  35.82 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  32.96 
 
 
276 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4372  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
475 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2353  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.657028  normal  0.419056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
443 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1921  histidine kinase  34.33 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000693193  hitchhiker  0.00000000000506219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  32.31 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
442 aa  128  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  36.25 
 
 
443 aa  128  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
453 aa  127  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2246  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
472 aa  126  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175843  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  34.98 
 
 
482 aa  126  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
442 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>