More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4045 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1745  putative membrane transport protein  75.68 
 
 		 446 aa  651    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4045  General substrate transporter  100 
 
 		 446 aa  870    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.849183  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5607  major facilitator protein family permease  68.92 
 
 		 439 aa  571  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1549  General substrate transporter  67.71 
 
 		 439 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.28146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1878  major facilitator superfamily MFS_1  68.19 
 
 		 439 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.232309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2224  major facilitator superfamily transporter  65.49 
 
 		 444 aa  545  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.199134  hitchhiker  0.000423669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4056  major facilitator transporter  63.4 
 
 		 445 aa  542  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713294  normal  0.178952 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4889  general substrate transporter  65.92 
 
 		 438 aa  531  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.321376  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4373  general substrate transporter  60.69 
 
 		 446 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5984  General substrate transporter  59.68 
 
 		 443 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5736  general substrate transporter  60.45 
 
 		 447 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0108237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4779  General substrate transporter  62.87 
 
 		 444 aa  502  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0207001  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7134  General substrate transporter  59.23 
 
 		 443 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0243  MFS permease  61.37 
 
 		 435 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1730  general substrate transporter  57.89 
 
 		 443 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366529  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4338  putative transmembrane transporter protein  60.7 
 
 		 472 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4707  putative transmembrane transporter protein  60.7 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.544234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1509  general substrate transporter  60.87 
 
 		 442 aa  483  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.386131 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4855  General substrate transporter  59.77 
 
 		 454 aa  482  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2029  major facilitator superfamily permease  59.91 
 
 		 436 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0594  general substrate transporter  59.91 
 
 		 441 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2264  General substrate transporter  63.68 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.176336  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2774  general substrate transporter  63.68 
 
 		 443 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.835468 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5109  major facilitator transporter  53.38 
 
 		 441 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2283  putative transport protein  42.32 
 
 		 418 aa  323  5e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.27 
 
 		 436 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2850  General substrate transporter  37.76 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.290987  hitchhiker  0.00573587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  36.98 
 
 		 431 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  36.82 
 
 		 445 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.16 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 425 aa  237  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  35.19 
 
 		 466 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  35.24 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  35.24 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  35.24 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.87 
 
 		 447 aa  233  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  33.98 
 
 		 470 aa  229  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 628 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0706  major facilitator family transporter  38.17 
 
 		 426 aa  228  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  33.33 
 
 		 470 aa  227  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 		 452 aa  226  7e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3830  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 463 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1332  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  35.95 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  31.8 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11030  Sugar (and other) transporter  34.72 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 839 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00467  metabolite transport protein  37.72 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.09 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.47 
 
 		 441 aa  210  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.92 
 
 		 440 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  34.43 
 
 		 435 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.47 
 
 		 442 aa  206  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3427  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.73 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.95 
 
 		 444 aa  201  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  30.6 
 
 		 482 aa  201  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.5 
 
 		 440 aa  199  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 435 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15920  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 437 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.246808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  35.71 
 
 		 489 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  34.64 
 
 		 437 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1510  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  33.33 
 
 		 456 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  34.64 
 
 		 437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  35.96 
 
 		 438 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.71 
 
 		 437 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  33.86 
 
 		 483 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  35.71 
 
 		 437 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  32.64 
 
 		 455 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  35.38 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0806  metabolite:proton symporter family protein  35.47 
 
 		 523 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.413485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1576  metabolite:proton symporter family protein  34.6 
 
 		 506 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342246  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  35.47 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.94 
 
 		 432 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.72 
 
 		 435 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  35.47 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  35.47 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 420 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  34.8 
 
 		 436 aa  193  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  34.18 
 
 		 436 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  34.98 
 
 		 436 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  34.48 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.49 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  35.94 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2856  metabolite transport protein  35.86 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0662  major facilitator family transporter  33.41 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  32.24 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  32.99 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0161  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 440 aa  190  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.99 
 
 		 438 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1295  general substrate transporter  37.25 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659237  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.34 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  32.85 
 
 		 440 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.139706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>