More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1549 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4889  general substrate transporter  76.26 
 
 		 438 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.321376  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1549  General substrate transporter  100 
 
 		 439 aa  856    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.28146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1878  major facilitator superfamily MFS_1  99.09 
 
 		 439 aa  851    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.232309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5607  major facilitator protein family permease  88.61 
 
 		 439 aa  776    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1745  putative membrane transport protein  66.59 
 
 		 446 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4045  General substrate transporter  67.71 
 
 		 446 aa  567  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.849183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2224  major facilitator superfamily transporter  64.42 
 
 		 444 aa  533  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.199134  hitchhiker  0.000423669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4056  major facilitator transporter  63.43 
 
 		 445 aa  531  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713294  normal  0.178952 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2774  general substrate transporter  64.89 
 
 		 443 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.835468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2264  General substrate transporter  64.65 
 
 		 443 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.176336  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5984  General substrate transporter  56.26 
 
 		 443 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4779  General substrate transporter  56.78 
 
 		 444 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0207001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0243  MFS permease  56.52 
 
 		 435 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1730  general substrate transporter  54.59 
 
 		 443 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366529  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4373  general substrate transporter  56.73 
 
 		 446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5736  general substrate transporter  54.84 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0108237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4855  General substrate transporter  55.8 
 
 		 454 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7134  General substrate transporter  57.69 
 
 		 443 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4338  putative transmembrane transporter protein  55.56 
 
 		 472 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4707  putative transmembrane transporter protein  55.56 
 
 		 444 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.544234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2029  major facilitator superfamily permease  57.46 
 
 		 436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1509  general substrate transporter  58.7 
 
 		 442 aa  438  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.386131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0594  general substrate transporter  57.49 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5109  major facilitator transporter  51.15 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2283  putative transport protein  43.28 
 
 		 418 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.42 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  36.5 
 
 		 431 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2850  General substrate transporter  37.85 
 
 		 437 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.290987  hitchhiker  0.00573587 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0706  major facilitator family transporter  37.41 
 
 		 426 aa  243  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  36.12 
 
 		 445 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  38.57 
 
 		 452 aa  242  9e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3830  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  35.02 
 
 		 628 aa  230  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  34.74 
 
 		 470 aa  230  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  34.93 
 
 		 470 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.91 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.79 
 
 		 447 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  34 
 
 		 466 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  35.85 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  35.85 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  35.85 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.83 
 
 		 441 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1332  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 		 433 aa  223  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 452 aa  222  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.23 
 
 		 440 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  34.52 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.44 
 
 		 433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.23 
 
 		 442 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3427  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.57 
 
 		 441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.58 
 
 		 444 aa  213  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11030  Sugar (and other) transporter  36.16 
 
 		 472 aa  210  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.48 
 
 		 440 aa  210  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  30.24 
 
 		 436 aa  209  1e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  32.46 
 
 		 482 aa  206  7e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  36.18 
 
 		 435 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  37.72 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  37.72 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  37.72 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  37.72 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00467  metabolite transport protein  35.41 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  37.47 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  34.35 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  35.02 
 
 		 437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 839 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  35.02 
 
 		 437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0662  major facilitator family transporter  35.87 
 
 		 393 aa  199  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  35.11 
 
 		 483 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  34.62 
 
 		 436 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.19 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  34.43 
 
 		 432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  33.56 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.46 
 
 		 438 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03371  predicted transporter  35.23 
 
 		 440 aa  196  9e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03324  hypothetical protein  35.23 
 
 		 440 aa  196  9e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0190  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.23 
 
 		 440 aa  196  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  34.38 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  32.16 
 
 		 438 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3928  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.23 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3726  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.23 
 
 		 440 aa  196  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3827  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.23 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0194  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.23 
 
 		 440 aa  196  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4011  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.23 
 
 		 440 aa  195  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  34.14 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15920  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.246808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4886  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35 
 
 		 440 aa  193  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  32.89 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 420 aa  190  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  35.28 
 
 		 456 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11224  integral membrane transport protein  31.19 
 
 		 425 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000679327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 420 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.66 
 
 		 435 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  34.41 
 
 		 489 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  34.41 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  32.06 
 
 		 446 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>