More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1730 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4707  putative transmembrane transporter protein  77.83 
 
 
444 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.544234  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1730  general substrate transporter  100 
 
 
443 aa  879    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366529  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4779  General substrate transporter  76.52 
 
 
444 aa  655    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0207001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4855  General substrate transporter  78.06 
 
 
454 aa  664    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4338  putative transmembrane transporter protein  77.6 
 
 
472 aa  651    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136921  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5736  general substrate transporter  70.55 
 
 
447 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0108237 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4373  general substrate transporter  60.6 
 
 
446 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1745  putative membrane transport protein  59.86 
 
 
446 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27935  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5984  General substrate transporter  58.09 
 
 
443 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4045  General substrate transporter  57.89 
 
 
446 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.849183  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7134  General substrate transporter  58.31 
 
 
443 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0243  MFS permease  54.36 
 
 
435 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5607  major facilitator protein family permease  55.9 
 
 
439 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361176  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2029  major facilitator superfamily permease  58.29 
 
 
436 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740262  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2224  major facilitator superfamily transporter  57.04 
 
 
444 aa  455  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.199134  hitchhiker  0.000423669 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1549  General substrate transporter  54.59 
 
 
439 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.28146 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1509  general substrate transporter  55.83 
 
 
442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.386131 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1878  major facilitator superfamily MFS_1  54.82 
 
 
439 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.232309 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4889  general substrate transporter  57.88 
 
 
438 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.321376  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4056  major facilitator transporter  53.53 
 
 
445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713294  normal  0.178952 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5109  major facilitator transporter  52.83 
 
 
441 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0594  general substrate transporter  54.82 
 
 
441 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2264  General substrate transporter  57.35 
 
 
443 aa  398  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.176336  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2774  general substrate transporter  57.11 
 
 
443 aa  398  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.835468 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2283  putative transport protein  42.72 
 
 
418 aa  318  9e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.59 
 
 
436 aa  264  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  36.04 
 
 
431 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2850  General substrate transporter  37.86 
 
 
437 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.290987  hitchhiker  0.00573587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  35.59 
 
 
445 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0706  major facilitator family transporter  39.7 
 
 
426 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3830  major facilitator transporter  38.16 
 
 
463 aa  243  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  34.47 
 
 
425 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  34 
 
 
463 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  34 
 
 
463 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  34 
 
 
463 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.45 
 
 
434 aa  236  8e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36 
 
 
440 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  34.27 
 
 
466 aa  232  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.74 
 
 
433 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.86 
 
 
441 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  33.49 
 
 
628 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.78 
 
 
442 aa  226  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  32.78 
 
 
436 aa  226  8e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00467  metabolite transport protein  37.25 
 
 
412 aa  223  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.79 
 
 
447 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.2 
 
 
440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1332  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 
433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 
452 aa  221  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  32.46 
 
 
482 aa  220  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.98 
 
 
444 aa  219  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3427  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.8 
 
 
441 aa  219  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  31.5 
 
 
470 aa  219  7.999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  31.99 
 
 
470 aa  216  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  33.81 
 
 
428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  34.82 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  34.82 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  34.82 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.06 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  34.82 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0662  major facilitator family transporter  37.19 
 
 
393 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03371  predicted transporter  33.63 
 
 
440 aa  209  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03324  hypothetical protein  33.63 
 
 
440 aa  209  9e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0194  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.63 
 
 
440 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0190  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.63 
 
 
440 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4886  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  33.63 
 
 
440 aa  209  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4011  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  33.63 
 
 
440 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3726  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  33.63 
 
 
440 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3928  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  33.41 
 
 
440 aa  207  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
839 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3827  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  33.41 
 
 
440 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 
436 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33.83 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  34.1 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  33.1 
 
 
435 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11030  Sugar (and other) transporter  32.88 
 
 
472 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  33.18 
 
 
436 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 
420 aa  200  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1510  major facilitator transporter  33.1 
 
 
425 aa  200  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15920  major facilitator transporter  36.75 
 
 
437 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.246808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  32.73 
 
 
436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  32.5 
 
 
436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1576  metabolite:proton symporter family protein  34.13 
 
 
506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342246  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  34.27 
 
 
433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  33.73 
 
 
437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  33.81 
 
 
489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  33.97 
 
 
438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  32.5 
 
 
437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  33.73 
 
 
437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  33.81 
 
 
455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  32.5 
 
 
437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  32.5 
 
 
436 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  33.73 
 
 
437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  33.73 
 
 
437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  32.65 
 
 
468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  33.73 
 
 
437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.97 
 
 
438 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  34.56 
 
 
420 aa  196  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 
420 aa  196  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  34.5 
 
 
442 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>