36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1297 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004001  hypothetical protein  49.21 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01521  hypothetical protein  49.21 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1485  putative lipoprotein  46.83 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.111399  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1885  hypothetical protein  31.75 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.424501 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1827  hypothetical protein  29.37 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000018447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3948  hypothetical protein  30.53 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1450  hypothetical protein  34.58 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1525  hypothetical protein  36.21 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0597  putative lipoprotein  28.12 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1656  hypothetical protein  28.12 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0458659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2720  hypothetical protein  30.83 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2753  hypothetical protein  31.86 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00414882  normal  0.159086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2504  hypothetical protein  29.69 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2381  hypothetical protein  28.93 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2322  hypothetical protein  32.8 
 
 		 136 aa  60.1  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.184994  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2311  hypothetical protein  28.91 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.312996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1734  hypothetical protein  32.17 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0319718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1793  hypothetical protein  32.43 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1921  hypothetical protein  35 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974088  hitchhiker  0.00000422281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1837  hypothetical protein  30.84 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.578477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2485  protein of unknown function DUF1425  30.84 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1801  hypothetical protein  30.84 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1697  hypothetical protein  30.36 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1589  putative lipoprotein  30.36 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0973064  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2815  putative lipoprotein  30.36 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.641789 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0632  hypothetical protein  29.46 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.656745 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0083  hypothetical protein  29.51 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.669157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5473  hypothetical protein  25 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1314  hypothetical protein  27.13 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1619  hypothetical protein  26.98 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0222346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2797  protein of unknown function DUF1425  27.73 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2515  hypothetical protein  37.29 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.28695 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1634  protein of unknown function DUF1425  26.79 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000957139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2491  hypothetical protein  29.07 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.265111  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1603  protein of unknown function DUF1425  29.67 
 
 		 129 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.974226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>