27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1450 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1450  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  285  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2753  hypothetical protein  61.4 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00414882  normal  0.159086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1885  hypothetical protein  56.59 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.424501 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1827  hypothetical protein  54.26 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000018447  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1525  hypothetical protein  51.15 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1793  hypothetical protein  57.52 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1656  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0458659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2720  hypothetical protein  50.81 
 
 		 131 aa  140  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2504  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152453 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1837  hypothetical protein  55.45 
 
 		 149 aa  136  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.578477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2381  hypothetical protein  51.2 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2485  protein of unknown function DUF1425  55.45 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1801  hypothetical protein  56.36 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2311  hypothetical protein  49.19 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.312996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2322  hypothetical protein  46.62 
 
 		 136 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.184994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1734  hypothetical protein  51.33 
 
 		 129 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0319718  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0597  putative lipoprotein  29.32 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  34.58 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004001  hypothetical protein  26.56 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1485  putative lipoprotein  25.89 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.111399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01521  hypothetical protein  28.91 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3948  hypothetical protein  26.09 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814332  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0605  hypothetical protein  26.92 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499566  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2515  hypothetical protein  31.4 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.28695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5473  hypothetical protein  22.94 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0083  hypothetical protein  24.81 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.669157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1634  protein of unknown function DUF1425  28.7 
 
 		 127 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000957139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>