26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1734 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1734  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0319718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1885  hypothetical protein  62.79 
 
 		 129 aa  174  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.424501 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1827  hypothetical protein  63.49 
 
 		 129 aa  173  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000018447  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2753  hypothetical protein  64.66 
 
 		 130 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00414882  normal  0.159086 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1525  hypothetical protein  58.4 
 
 		 130 aa  147  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1793  hypothetical protein  55.75 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2720  hypothetical protein  52.38 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2504  hypothetical protein  51.59 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152453 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1656  hypothetical protein  49.21 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0458659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2485  protein of unknown function DUF1425  55.45 
 
 		 131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1801  hypothetical protein  55.45 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2381  hypothetical protein  50.79 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1837  hypothetical protein  55.45 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.578477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2311  hypothetical protein  50.79 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.312996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1450  hypothetical protein  50.88 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2322  hypothetical protein  41.73 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.184994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0597  putative lipoprotein  30.85 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004001  hypothetical protein  27.69 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  32.56 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01521  hypothetical protein  26.92 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3948  hypothetical protein  23.96 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814332  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1485  putative lipoprotein  23.21 
 
 		 129 aa  50.1  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.111399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2797  protein of unknown function DUF1425  29.41 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1314  hypothetical protein  33.06 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303658  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2491  hypothetical protein  28.91 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.265111  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2515  hypothetical protein  32.63 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.28695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>