24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2491 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2491  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  260  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.265111  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2797  protein of unknown function DUF1425  92.06 
 
 		 126 aa  245  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1921  hypothetical protein  47.5 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974088  hitchhiker  0.00000422281 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1634  protein of unknown function DUF1425  50 
 
 		 127 aa  117  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000957139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1603  protein of unknown function DUF1425  46.02 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.974226  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1697  hypothetical protein  42.15 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2815  putative lipoprotein  42.15 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.641789 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1589  putative lipoprotein  42.15 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0973064  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1619  hypothetical protein  39.47 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0222346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1305  putative outer membrane lipoprotein  39.64 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.038619  hitchhiker  0.000000015762 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1320  hypothetical protein  39.64 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.337509  hitchhiker  0.00000317793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1282  putative outer membrane lipoprotein  39.64 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.930461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1979  putative outer membrane lipoprotein  39.64 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.851115  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2163  putative outer membrane lipoprotein  39.64 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000237619 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2022  putative lipoprotein  37.84 
 
 		 117 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.244629  hitchhiker  0.0000130973 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1226  putative lipoprotein  37.96 
 
 		 125 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000337713  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2219  putative lipoprotein  37.96 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0438807  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1484  putative lipoprotein  37.96 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.677422  hitchhiker  0.0000606348 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2543  protein of unknown function DUF1425  37.96 
 
 		 125 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00379856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01100  hypothetical protein  37.04 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2497  hypothetical protein  37.04 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.874028  hitchhiker  0.000000243666 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01108  hypothetical protein  37.04 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1227  putative lipoprotein  37.04 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447806  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1485  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.111399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>