26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1697 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1697  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  262  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1589  putative lipoprotein  99.22 
 
 
129 aa  259  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0973064  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2815  putative lipoprotein  99.22 
 
 
129 aa  259  8e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.641789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1921  hypothetical protein  58.14 
 
 
129 aa  148  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974088  hitchhiker  0.00000422281 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2797  protein of unknown function DUF1425  44.17 
 
 
126 aa  104  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2022  putative lipoprotein  47.27 
 
 
117 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.244629  hitchhiker  0.0000130973 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2491  hypothetical protein  42.15 
 
 
126 aa  102  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.265111  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1634  protein of unknown function DUF1425  43.52 
 
 
127 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000957139  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1619  hypothetical protein  43.7 
 
 
124 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0222346  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2219  putative lipoprotein  46.3 
 
 
125 aa  100  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0438807  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1484  putative lipoprotein  46.3 
 
 
125 aa  100  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.677422  hitchhiker  0.0000606348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2497  hypothetical protein  46.3 
 
 
125 aa  100  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.874028  hitchhiker  0.000000243666 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01100  hypothetical protein  46.3 
 
 
125 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1227  putative lipoprotein  46.3 
 
 
125 aa  100  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01108  hypothetical protein  46.3 
 
 
125 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1226  putative lipoprotein  46.3 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000337713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2543  protein of unknown function DUF1425  45.37 
 
 
125 aa  99  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00379856  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1305  putative outer membrane lipoprotein  43.64 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.038619  hitchhiker  0.000000015762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2163  putative outer membrane lipoprotein  43.64 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000237619 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1979  putative outer membrane lipoprotein  43.64 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.851115  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1282  putative outer membrane lipoprotein  43.64 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.930461  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1320  hypothetical protein  43.64 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.337509  hitchhiker  0.00000317793 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1603  protein of unknown function DUF1425  32.5 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.974226  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  31.63 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004001  hypothetical protein  28.33 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1485  putative lipoprotein  28.83 
 
 
129 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.111399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>