40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1485 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1485  putative lipoprotein  100 
 
 		 129 aa  265  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.111399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004001  hypothetical protein  58.27 
 
 		 130 aa  169  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01521  hypothetical protein  55.91 
 
 		 130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  46.83 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1525  hypothetical protein  32 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3948  hypothetical protein  30.08 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1827  hypothetical protein  25.98 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000018447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1656  hypothetical protein  30.33 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0458659  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2504  hypothetical protein  30 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2381  hypothetical protein  30 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2311  hypothetical protein  28.33 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.312996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2720  hypothetical protein  28.69 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1793  hypothetical protein  26.13 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1450  hypothetical protein  25.89 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2322  hypothetical protein  27.19 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.184994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1885  hypothetical protein  21.26 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.424501 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1837  hypothetical protein  26.61 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.578477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1801  hypothetical protein  26.61 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2485  protein of unknown function DUF1425  26.61 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1921  hypothetical protein  26.61 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974088  hitchhiker  0.00000422281 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2753  hypothetical protein  22.81 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00414882  normal  0.159086 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0597  putative lipoprotein  28.03 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1634  protein of unknown function DUF1425  29.36 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000957139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2797  protein of unknown function DUF1425  29.37 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1734  hypothetical protein  23.42 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0319718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2491  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.265111  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1603  protein of unknown function DUF1425  27.27 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.974226  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1619  hypothetical protein  30.53 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0222346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1314  hypothetical protein  25.4 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303658  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1979  putative outer membrane lipoprotein  27 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.851115  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2163  putative outer membrane lipoprotein  27 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000237619 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1282  putative outer membrane lipoprotein  27 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.930461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1320  hypothetical protein  27 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.337509  hitchhiker  0.00000317793 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1305  putative outer membrane lipoprotein  27 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.038619  hitchhiker  0.000000015762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1589  putative lipoprotein  30.33 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0973064  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0632  hypothetical protein  26.19 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.656745 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1697  hypothetical protein  30.33 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2815  putative lipoprotein  30.33 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.641789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2022  putative lipoprotein  28 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.244629  hitchhiker  0.0000130973 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0083  hypothetical protein  23.88 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.669157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>