27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1525 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1525  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1656  hypothetical protein  66.13 
 
 		 131 aa  179  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0458659  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2504  hypothetical protein  66.41 
 
 		 130 aa  179  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2381  hypothetical protein  66.41 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2311  hypothetical protein  65.62 
 
 		 130 aa  176  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.312996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2720  hypothetical protein  64.84 
 
 		 131 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1793  hypothetical protein  71.68 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1801  hypothetical protein  70.91 
 
 		 149 aa  168  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1837  hypothetical protein  70.91 
 
 		 149 aa  168  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.578477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2485  protein of unknown function DUF1425  69.09 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2753  hypothetical protein  62.07 
 
 		 130 aa  161  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00414882  normal  0.159086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1885  hypothetical protein  53.49 
 
 		 129 aa  156  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.424501 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1827  hypothetical protein  52.8 
 
 		 129 aa  153  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000018447  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1450  hypothetical protein  54.78 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1734  hypothetical protein  59.13 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0319718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2322  hypothetical protein  46.62 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.184994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3948  hypothetical protein  36.17 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0597  putative lipoprotein  32.06 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1485  putative lipoprotein  31.25 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.111399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004001  hypothetical protein  29.37 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01521  hypothetical protein  29.91 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  35.19 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2515  hypothetical protein  24.39 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.28695 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0632  hypothetical protein  32.47 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.656745 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1314  hypothetical protein  27.43 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303658  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0083  hypothetical protein  23.97 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.669157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1603  protein of unknown function DUF1425  19.51 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.974226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>