25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2515 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2515  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  277  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.28695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5473  hypothetical protein  34.86 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0605  hypothetical protein  39.13 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499566  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0632  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.656745 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1314  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303658  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0597  putative lipoprotein  36.05 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2322  hypothetical protein  29.25 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.184994  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1525  hypothetical protein  24.39 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2720  hypothetical protein  27.83 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2753  hypothetical protein  40.91 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00414882  normal  0.159086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1656  hypothetical protein  26.27 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0458659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3948  hypothetical protein  25.61 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1827  hypothetical protein  35.11 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000018447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2504  hypothetical protein  28.05 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2381  hypothetical protein  28.05 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2311  hypothetical protein  27.97 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.312996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1450  hypothetical protein  31.4 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1837  hypothetical protein  31.43 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.578477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1885  hypothetical protein  27.78 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.424501 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  37.29 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2485  protein of unknown function DUF1425  38 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1793  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1801  hypothetical protein  38 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1734  hypothetical protein  29.91 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0319718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004001  hypothetical protein  22.22 
 
 		 130 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>