23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2753 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2753  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00414882  normal  0.159086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1885  hypothetical protein  73.44 
 
 		 129 aa  209  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.424501 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1827  hypothetical protein  66.41 
 
 		 129 aa  193  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000018447  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1525  hypothetical protein  60.77 
 
 		 130 aa  174  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2720  hypothetical protein  59.68 
 
 		 131 aa  167  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1656  hypothetical protein  58.87 
 
 		 131 aa  166  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0458659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1793  hypothetical protein  62.83 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2504  hypothetical protein  58.06 
 
 		 130 aa  160  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152453 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1734  hypothetical protein  65.22 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0319718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2381  hypothetical protein  58.2 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2311  hypothetical protein  57.26 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.312996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1450  hypothetical protein  61.4 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1837  hypothetical protein  63.64 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.578477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1801  hypothetical protein  62.73 
 
 		 149 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2485  protein of unknown function DUF1425  61.82 
 
 		 131 aa  156  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2322  hypothetical protein  49.14 
 
 		 136 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.184994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0597  putative lipoprotein  37.12 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  30.16 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004001  hypothetical protein  24.03 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3948  hypothetical protein  24.03 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814332  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1485  putative lipoprotein  23.21 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.111399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01521  hypothetical protein  22.48 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2515  hypothetical protein  40.91 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.28695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>