26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1827 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1827  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  269  8.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000018447  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1885  hypothetical protein  69.77 
 
 
129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.424501 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2753  hypothetical protein  66.41 
 
 
130 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00414882  normal  0.159086 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1734  hypothetical protein  66.09 
 
 
129 aa  169  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0319718  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1656  hypothetical protein  52.67 
 
 
131 aa  157  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0458659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1793  hypothetical protein  57.52 
 
 
149 aa  153  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1525  hypothetical protein  52.8 
 
 
130 aa  153  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2720  hypothetical protein  52.67 
 
 
131 aa  152  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1450  hypothetical protein  59.29 
 
 
139 aa  150  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2504  hypothetical protein  52.67 
 
 
130 aa  150  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2381  hypothetical protein  51.91 
 
 
130 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2311  hypothetical protein  51.15 
 
 
130 aa  146  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.312996  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2485  protein of unknown function DUF1425  57.27 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000435255  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1837  hypothetical protein  57.27 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.578477  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1801  hypothetical protein  57.27 
 
 
149 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2322  hypothetical protein  48.03 
 
 
136 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.184994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0597  putative lipoprotein  31.3 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004001  hypothetical protein  29.23 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01521  hypothetical protein  27.69 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3948  hypothetical protein  25.76 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814332  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  29.37 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1485  putative lipoprotein  25.23 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.111399  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2515  hypothetical protein  35.11 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.28695 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1314  hypothetical protein  30.16 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303658  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0632  hypothetical protein  30.65 
 
 
118 aa  47.4  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.656745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5473  hypothetical protein  27.78 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.748721 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>