24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2322 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2322  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  279  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.184994  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1656  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0458659  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1885  hypothetical protein  52.38 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.424501 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2720  hypothetical protein  48.48 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2311  hypothetical protein  48.48 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.312996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1793  hypothetical protein  53.98 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2504  hypothetical protein  47.73 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152453 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1827  hypothetical protein  48.03 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000018447  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2381  hypothetical protein  45.67 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2753  hypothetical protein  49.14 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00414882  normal  0.159086 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2485  protein of unknown function DUF1425  51.35 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1837  hypothetical protein  51.35 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.578477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1801  hypothetical protein  52.25 
 
 		 149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1525  hypothetical protein  46.62 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1450  hypothetical protein  50.88 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1734  hypothetical protein  41.74 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0319718  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0597  putative lipoprotein  32.81 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3948  hypothetical protein  28.46 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814332  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1485  putative lipoprotein  27.68 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.111399  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004001  hypothetical protein  23.39 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2515  hypothetical protein  29.25 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.28695 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01521  hypothetical protein  23.08 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5473  hypothetical protein  21.82 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>