15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5473 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5473  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  255  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2515  hypothetical protein  36.44 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.28695 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0605  hypothetical protein  36.29 
 
 		 131 aa  88.6  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499566  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1314  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303658  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0632  hypothetical protein  35.59 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.656745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0597  putative lipoprotein  27.82 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1885  hypothetical protein  24.59 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.424501 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  25 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2322  hypothetical protein  21.49 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.184994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1450  hypothetical protein  22.94 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1656  hypothetical protein  23.53 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0458659  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0125  putative lipoprotein  26.83 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1827  hypothetical protein  27.78 
 
 		 129 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000018447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3948  hypothetical protein  27.54 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2720  hypothetical protein  23.53 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>