26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2720 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2720  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2311  hypothetical protein  91.6 
 
 		 130 aa  245  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.312996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2504  hypothetical protein  90.08 
 
 		 130 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2381  hypothetical protein  89.31 
 
 		 130 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1656  hypothetical protein  85.5 
 
 		 131 aa  237  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0458659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1793  hypothetical protein  83.21 
 
 		 149 aa  206  9e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1837  hypothetical protein  84.73 
 
 		 149 aa  204  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.578477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2485  protein of unknown function DUF1425  83.21 
 
 		 131 aa  201  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1801  hypothetical protein  83.97 
 
 		 149 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1525  hypothetical protein  64.84 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2753  hypothetical protein  59.48 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00414882  normal  0.159086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1885  hypothetical protein  53.44 
 
 		 129 aa  157  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.424501 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1827  hypothetical protein  52.67 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000018447  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2322  hypothetical protein  48.48 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.184994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1450  hypothetical protein  53.04 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1734  hypothetical protein  52.63 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0319718  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0597  putative lipoprotein  31.52 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3948  hypothetical protein  27.48 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814332  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1485  putative lipoprotein  27.68 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.111399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004001  hypothetical protein  26.92 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01521  hypothetical protein  26.56 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  29.57 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2515  hypothetical protein  27.83 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.28695 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0083  hypothetical protein  25.93 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.669157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1314  hypothetical protein  26.32 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303658  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0605  hypothetical protein  28.75 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499566  normal  0.455576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>