23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2485 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2485  protein of unknown function DUF1425  100 
 
 
131 aa  268  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000435255  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1656  hypothetical protein  85.5 
 
 
131 aa  239  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0458659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2720  hypothetical protein  83.21 
 
 
131 aa  233  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2504  hypothetical protein  85.5 
 
 
130 aa  233  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2381  hypothetical protein  84.73 
 
 
130 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1793  hypothetical protein  96.18 
 
 
149 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2311  hypothetical protein  84.73 
 
 
130 aa  231  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.312996  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1801  hypothetical protein  97.71 
 
 
149 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1837  hypothetical protein  97.71 
 
 
149 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.578477  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1525  hypothetical protein  65.12 
 
 
130 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1885  hypothetical protein  56.49 
 
 
129 aa  168  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.424501 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2753  hypothetical protein  62.28 
 
 
130 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00414882  normal  0.159086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1827  hypothetical protein  54.96 
 
 
129 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000018447  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2322  hypothetical protein  49.62 
 
 
136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.184994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1450  hypothetical protein  55.65 
 
 
139 aa  144  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1734  hypothetical protein  56.14 
 
 
129 aa  141  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0319718  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0597  putative lipoprotein  30.11 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3948  hypothetical protein  29.01 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814332  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004001  hypothetical protein  29.69 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1485  putative lipoprotein  26.79 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.111399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01521  hypothetical protein  29.37 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  31.53 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2515  hypothetical protein  38 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.28695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>