24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1793 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1793  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  306  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1801  hypothetical protein  97.32 
 
 
149 aa  266  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1837  hypothetical protein  95.97 
 
 
149 aa  262  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.578477  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1656  hypothetical protein  85.5 
 
 
131 aa  239  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0458659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2720  hypothetical protein  83.21 
 
 
131 aa  231  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2504  hypothetical protein  83.97 
 
 
130 aa  229  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2381  hypothetical protein  83.21 
 
 
130 aa  228  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2311  hypothetical protein  83.21 
 
 
130 aa  226  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.312996  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2485  protein of unknown function DUF1425  96.18 
 
 
131 aa  224  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000435255  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1525  hypothetical protein  66.67 
 
 
130 aa  184  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1885  hypothetical protein  55.73 
 
 
129 aa  167  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.424501 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2753  hypothetical protein  63.16 
 
 
130 aa  166  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00414882  normal  0.159086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1827  hypothetical protein  54.2 
 
 
129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000018447  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2322  hypothetical protein  51.88 
 
 
136 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.184994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1450  hypothetical protein  57.39 
 
 
139 aa  147  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1734  hypothetical protein  56.14 
 
 
129 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0319718  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0597  putative lipoprotein  28.12 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3948  hypothetical protein  28.79 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814332  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1485  putative lipoprotein  25.89 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.111399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004001  hypothetical protein  26.77 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01521  hypothetical protein  28.57 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  32.43 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2515  hypothetical protein  26.27 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.28695 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0083  hypothetical protein  24.44 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.669157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>