25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2311 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2311  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  265  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.312996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2504  hypothetical protein  98.46 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2381  hypothetical protein  97.69 
 
 		 130 aa  260  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2720  hypothetical protein  91.6 
 
 		 131 aa  245  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1656  hypothetical protein  87.79 
 
 		 131 aa  237  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0458659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1837  hypothetical protein  87.39 
 
 		 149 aa  204  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.578477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1793  hypothetical protein  83.21 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2485  protein of unknown function DUF1425  85.59 
 
 		 131 aa  201  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1801  hypothetical protein  86.49 
 
 		 149 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1525  hypothetical protein  65.62 
 
 		 130 aa  176  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2753  hypothetical protein  57.89 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00414882  normal  0.159086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1885  hypothetical protein  52.03 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.424501 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1827  hypothetical protein  51.15 
 
 		 129 aa  146  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000018447  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2322  hypothetical protein  48.48 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.184994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1450  hypothetical protein  50.88 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1734  hypothetical protein  50.88 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0319718  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0597  putative lipoprotein  28.91 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3948  hypothetical protein  27.69 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814332  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1485  putative lipoprotein  27.68 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.111399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004001  hypothetical protein  30.15 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01521  hypothetical protein  28.68 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  27.62 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2515  hypothetical protein  27.97 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.28695 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0083  hypothetical protein  26.12 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.669157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1634  protein of unknown function DUF1425  26.17 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000957139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>