25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01521 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01521  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  270  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004001  hypothetical protein  90 
 
 
130 aa  248  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1485  putative lipoprotein  55.91 
 
 
129 aa  153  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.111399  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  49.21 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1525  hypothetical protein  29.91 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1827  hypothetical protein  27.69 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000018447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1656  hypothetical protein  26.83 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0458659  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2504  hypothetical protein  27.82 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152453 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1450  hypothetical protein  28.21 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2311  hypothetical protein  28.68 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.312996  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2381  hypothetical protein  28 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2720  hypothetical protein  26.56 
 
 
131 aa  57.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3948  hypothetical protein  27.41 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1793  hypothetical protein  29.06 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2753  hypothetical protein  23.93 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00414882  normal  0.159086 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2322  hypothetical protein  23.08 
 
 
136 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.184994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1837  hypothetical protein  28.07 
 
 
149 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.578477  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2485  protein of unknown function DUF1425  28.07 
 
 
131 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000435255  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1734  hypothetical protein  26.72 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0319718  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1801  hypothetical protein  28.07 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1619  hypothetical protein  29.7 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0222346  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1885  hypothetical protein  20.77 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.424501 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1603  protein of unknown function DUF1425  26.5 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.974226  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0597  putative lipoprotein  20.15 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1921  hypothetical protein  24.32 
 
 
129 aa  40.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974088  hitchhiker  0.00000422281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>