28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0597 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0597  putative lipoprotein  100 
 
 		 157 aa  327  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2322  hypothetical protein  32.81 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.184994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2753  hypothetical protein  36.07 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00414882  normal  0.159086 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2381  hypothetical protein  29.69 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2504  hypothetical protein  29.69 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152453 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1525  hypothetical protein  32.06 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1827  hypothetical protein  31.3 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000018447  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2311  hypothetical protein  28.91 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.312996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1656  hypothetical protein  34.41 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0458659  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1885  hypothetical protein  29.77 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.424501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3948  hypothetical protein  26.15 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1450  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2720  hypothetical protein  31.52 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1793  hypothetical protein  29.9 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1837  hypothetical protein  31.18 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.578477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2485  protein of unknown function DUF1425  30.11 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1801  hypothetical protein  30.11 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1297  putative lipoprotein  31.4 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.817977  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1734  hypothetical protein  30.53 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0319718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2515  hypothetical protein  36.05 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.28695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5473  hypothetical protein  26.23 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1485  putative lipoprotein  25.77 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.111399  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1314  hypothetical protein  29.87 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303658  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0632  hypothetical protein  28.57 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.656745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0605  hypothetical protein  25.32 
 
 		 131 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499566  normal  0.455576 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01521  hypothetical protein  20.15 
 
 		 130 aa  41.6  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1192  hypothetical protein  24.81 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00492168  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004001  hypothetical protein  21.01 
 
 		 130 aa  40.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>