125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06898 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06898  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  335  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  79.07 
 
 		 414 aa  224  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  75.81 
 
 		 392 aa  211  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  41.18 
 
 		 363 aa  101  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  40.28 
 
 		 376 aa  99.8  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  41.8 
 
 		 333 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  39.06 
 
 		 377 aa  94.4  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  35.48 
 
 		 351 aa  93.6  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  32.84 
 
 		 351 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.82 
 
 		 380 aa  88.6  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.33 
 
 		 378 aa  88.6  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  36.59 
 
 		 361 aa  87.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  36.51 
 
 		 367 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.33 
 
 		 374 aa  87.4  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.33 
 
 		 374 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  33.06 
 
 		 362 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  35 
 
 		 381 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  35.71 
 
 		 320 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  34.92 
 
 		 320 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  34.92 
 
 		 320 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  34.92 
 
 		 320 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  38.33 
 
 		 383 aa  84  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  34.92 
 
 		 320 aa  84  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.3 
 
 		 367 aa  84  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  34.13 
 
 		 320 aa  84  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  33.88 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  30.77 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  33.06 
 
 		 374 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  33.88 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  33.88 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  34.17 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2463  outer membrane protein  34.13 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  34.4 
 
 		 363 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.6 
 
 		 385 aa  82  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  33.33 
 
 		 368 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  32.58 
 
 		 369 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  34.15 
 
 		 366 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  34.85 
 
 		 377 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  34.71 
 
 		 361 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  29.25 
 
 		 372 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  34.17 
 
 		 376 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  34.43 
 
 		 372 aa  80.5  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  32.5 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  32.8 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1097  Zn-dependent hydrolase  35.54 
 
 		 366 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  32.26 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  35.83 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  32.81 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  32.65 
 
 		 353 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  31.25 
 
 		 364 aa  79  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 		 367 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  33.08 
 
 		 363 aa  79  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  31.01 
 
 		 362 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  32.26 
 
 		 320 aa  77.8  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  77.8  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  31.45 
 
 		 320 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  29.86 
 
 		 358 aa  77.8  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  31.54 
 
 		 375 aa  77.4  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3122  metallo-beta-lactamase family protein  33.58 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  30.83 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  30.08 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  30.08 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  30.08 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.78 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  33.07 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  32.79 
 
 		 371 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  28.87 
 
 		 403 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.12 
 
 		 376 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  31.03 
 
 		 354 aa  74.7  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.21 
 
 		 419 aa  74.3  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  28.37 
 
 		 388 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  27.74 
 
 		 358 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.67 
 
 		 353 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  31.45 
 
 		 364 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  31.5 
 
 		 372 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  31.5 
 
 		 356 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  27.89 
 
 		 367 aa  71.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  30.71 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  25.98 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  27.78 
 
 		 371 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  35.05 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  27.68 
 
 		 335 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  36.61 
 
 		 303 aa  60.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  30.28 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  34.15 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  36.46 
 
 		 348 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  27.61 
 
 		 396 aa  57  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2753  outer membrane protein RomA  35.14 
 
 		 76 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000480988  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.24 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02155  hypothetical protein  88.46 
 
 		 284 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.48 
 
 		 354 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  29.41 
 
 		 357 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.09 
 
 		 325 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  29.46 
 
 		 296 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  27.43 
 
 		 342 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  27.43 
 
 		 342 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 		 329 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0835  putative Zn-dependent hydrolase  34.91 
 
 		 332 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>