More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05250 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05250  chemotaxis protein CheV  100 
 
 		 304 aa  629  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001360  chemotaxis protein CheV  92.11 
 
 		 304 aa  585  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0285  putative chemotaxis protein CheV  81.52 
 
 		 306 aa  518  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0498  putative chemotaxis protein, CheW-like  68.03 
 
 		 302 aa  441  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.857231  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  62.08 
 
 		 300 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  62.16 
 
 		 298 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  61.62 
 
 		 308 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  61.69 
 
 		 299 aa  391  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  61.36 
 
 		 299 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  61.36 
 
 		 299 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  61.43 
 
 		 295 aa  391  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  62.59 
 
 		 314 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  61.94 
 
 		 299 aa  387  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  61.25 
 
 		 299 aa  387  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  62.5 
 
 		 299 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2527  CheW-like protein  61.99 
 
 		 297 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  61.94 
 
 		 298 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  61.94 
 
 		 298 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  61.94 
 
 		 298 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  61.94 
 
 		 298 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3396  putative CheW protein  53.58 
 
 		 295 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  35.99 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  37.37 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  36.84 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  37.72 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  37.72 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  37.72 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  35.94 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  37.01 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  37.01 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  37.72 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  36.3 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  36.65 
 
 		 306 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  36.65 
 
 		 306 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  36.65 
 
 		 306 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  36.65 
 
 		 306 aa  189  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  36.65 
 
 		 306 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  38.25 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  36.65 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  36.65 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  35.59 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  36.65 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  38.52 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  37.81 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  34.88 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  36.52 
 
 		 310 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  35.23 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  35.23 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  33.21 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  31.51 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  34.58 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  33.33 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  34.58 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  36.33 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  35.56 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  33.79 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  34.86 
 
 		 308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  33.22 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  35.09 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  35.09 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  35.79 
 
 		 338 aa  172  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  34.24 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  34.24 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  33.68 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  33.68 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  34.66 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  33.68 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  35.34 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  33.9 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  33.68 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  31.41 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  34.04 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  36.04 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  32.48 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  32.88 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  34.27 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  32.98 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  33.94 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  33.58 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  32.49 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  31.9 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  32.26 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  33.33 
 
 		 317 aa  165  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  33.56 
 
 		 306 aa  165  9e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  33.57 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  33.21 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4654  CheW protein  34.59 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  31.94 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  35.11 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  31.85 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  31.9 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1139  response regulator receiver:CheW-like protein  33.22 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4384  response regulator receiver modulated CheW protein  34.04 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.234409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1323  chemotaxis protein CheV, putative  33.22 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  31.54 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  33.45 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  31.65 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  31.58 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  31.58 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  32.89 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>