72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00861 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00861  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  417  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2021  hypothetical protein  68.47 
 
 		 202 aa  270  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2683  hypothetical protein  59.61 
 
 		 203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0191282  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001610  hypothetical protein  91.18 
 
 		 102 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000183596  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2333  SH3-like region  36.76 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0682642  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3852  SH3, type 3  35.61 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000664747  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03714  SH3, type 3  38.8 
 
 		 258 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000284257  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3566  putative signal transduction protein  39.8 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0567  SH3 type 3 domain-containing protein  38.19 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3407  putative signal transduction protein  38.78 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1910  hypothetical protein  34.2 
 
 		 249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00493464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3497  SH3-like region  34.05 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4292  putative signal transduction protein  38.58 
 
 		 206 aa  121  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000541961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3458  putative signal transduction protein  38.78 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000279998  normal  0.164628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10220  SH3 domain-containing protein  33.51 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0933  hypothetical protein  33.51 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0715  SH3 type 3 domain-containing protein  33.5 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000965232  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3489  SH3 type 3 domain-containing protein  33.51 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000200384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2285  SH3 type 3 domain-containing protein  32.16 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150232  normal  0.248949 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0644  putative signal transduction protein  36.22 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000398097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3348  putative signal transduction protein  36.22 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3518  putative signal transduction protein  36.22 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3232  putative signal transduction protein  36.22 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4367  putative signal transduction protein  36.22 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02875  hypothetical protein  36.22 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000049587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0645  SH3 domain protein  36.22 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.8262e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02925  predicted signal transduction protein (SH3 domain)  36.22 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000497007  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0179  SH3 type 3 domain-containing protein  35.68 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0295  putative signal transduction protein  36.87 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.023009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0642  putative signal transduction protein  36.87 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000817142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0561  putative signal transduction protein  36.87 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117264  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3631  hypothetical protein  32.63 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0330275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2102  SH3 type 3 domain-containing protein  32.63 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.106073  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0616  SH3 domain-containing protein  33.86 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0915  SH3 type 3 domain-containing protein  31.49 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000529775  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4197  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0690  SH3, type 3  32.49 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000176512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2369  SH3 type 3 domain-containing protein  29.51 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0831  putative signal transduction protein  39.66 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3463  putative signal transduction protein  36.67 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3457  putative signal transduction protein  36.67 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.262114 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3393  putative signal transduction protein  36.67 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3389  putative signal transduction protein  36.67 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3559  putative signal transduction protein  36.67 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.617319  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3097  SH3 type 3 domain-containing protein  33.16 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3845  SH3 domain-containing protein  32.28 
 
 		 181 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000383374  hitchhiker  0.0000000226441 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2675  SH3 domain-containing protein  31.49 
 
 		 200 aa  98.2  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000104931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3098  SH3 type 3 domain-containing protein  31.44 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000537469  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0797  putative signal transduction protein  37.02 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3772  hypothetical protein  27.46 
 
 		 182 aa  89.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0820  SH3 type 3 domain-containing protein  27.84 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0851  SH3 domain-containing protein  27.84 
 
 		 182 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3121  SH3 domain-containing protein  27.84 
 
 		 182 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.278206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1715  SH3 domain-containing protein  28.83 
 
 		 245 aa  86.3  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3457  SH3 type 3 domain-containing protein  31.25 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000152698  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0881  SH3 type 3 domain-containing protein  31.25 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0905  SH3 type 3 domain protein  34.01 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000893023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1880  SH3 type 3 domain-containing protein  26.64 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2532  hypothetical protein  30.05 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3683  SH3 type 3 domain-containing protein  25.69 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1192  hypothetical protein  31 
 
 		 263 aa  71.2  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2044  hypothetical protein  25.94 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.74668  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0747  SH3 type 3 domain protein  25.44 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.737652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0726  SH3 type 3 domain protein  22.28 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0365  hypothetical protein  29.85 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.529008 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0499  hypothetical protein  25.82 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3625  SH3 type 3 domain-containing protein  25.78 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000261951  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2347  hypothetical protein  26.01 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443383 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1504  SH3-like region  19.88 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1153  SH3 type 3 domain-containing protein  34.43 
 
 		 509 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  32.79 
 
 		 510 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  33.93 
 
 		 370 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>