47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0726 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0726  SH3 type 3 domain protein  100 
 
 		 214 aa  430  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0499  hypothetical protein  35.81 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2532  hypothetical protein  31.12 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1489  SH3 type 3 domain-containing protein  31.05 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023318  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2044  hypothetical protein  32.88 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.74668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3625  SH3 type 3 domain-containing protein  28.7 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000261951  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2333  SH3-like region  32.09 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0682642  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1715  SH3 domain-containing protein  25.84 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1880  SH3 type 3 domain-containing protein  27.09 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3683  SH3 type 3 domain-containing protein  30.95 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0365  hypothetical protein  30.86 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.529008 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0747  SH3 type 3 domain protein  25 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.737652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1504  SH3-like region  28.74 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015461  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0915  SH3 type 3 domain-containing protein  32.65 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000529775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2347  hypothetical protein  27.5 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443383 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2683  hypothetical protein  23.56 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0191282  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1910  hypothetical protein  28.86 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00493464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10220  SH3 domain-containing protein  25.98 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0905  SH3 type 3 domain protein  29.81 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000893023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00861  hypothetical protein  24.79 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0933  hypothetical protein  25.98 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3497  SH3-like region  28.57 
 
 		 276 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3098  SH3 type 3 domain-containing protein  27.94 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000537469  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3457  SH3 type 3 domain-containing protein  31.97 
 
 		 183 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000152698  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0881  SH3 type 3 domain-containing protein  31.29 
 
 		 182 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001426  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2021  hypothetical protein  24.57 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002011  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03714  SH3, type 3  23.98 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000284257  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2285  SH3 type 3 domain-containing protein  26.36 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150232  normal  0.248949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2102  SH3 type 3 domain-containing protein  25.45 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.106073  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3631  hypothetical protein  25.45 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0330275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3097  SH3 type 3 domain-containing protein  31.78 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3772  hypothetical protein  29.69 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0179  SH3 type 3 domain-containing protein  28.79 
 
 		 189 aa  49.3  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0820  SH3 type 3 domain-containing protein  29.51 
 
 		 182 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  30.61 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0851  SH3 domain-containing protein  24.51 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2675  SH3 domain-containing protein  26.9 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000104931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  30.77 
 
 		 370 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  32.91 
 
 		 319 aa  45.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3121  SH3 domain-containing protein  24.02 
 
 		 182 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.278206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3852  SH3, type 3  22.73 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000664747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  26.72 
 
 		 337 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3489  SH3 type 3 domain-containing protein  26.21 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000200384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2369  SH3 type 3 domain-containing protein  26.79 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4197  hypothetical protein  24.5 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  29.85 
 
 		 575 aa  41.6  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.94 
 
 		 448 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>