22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3625 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3625  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000261951  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0726  SH3 type 3 domain protein  30.6 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1489  SH3 type 3 domain-containing protein  27.4 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023318  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1880  SH3 type 3 domain-containing protein  26.96 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2532  hypothetical protein  26.8 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3683  SH3 type 3 domain-containing protein  26.48 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0365  hypothetical protein  28.41 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.529008 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2044  hypothetical protein  26.99 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.74668  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1504  SH3-like region  22.36 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0499  hypothetical protein  26.17 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00861  hypothetical protein  27.87 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4197  hypothetical protein  24.65 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2021  hypothetical protein  25.17 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2333  SH3-like region  27.06 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0682642  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2683  hypothetical protein  26 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0191282  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03714  SH3, type 3  21.43 
 
 		 258 aa  45.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000284257  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3489  SH3 type 3 domain-containing protein  30.07 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000200384  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0715  SH3 type 3 domain-containing protein  24.87 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000965232  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2081  hypothetical protein  28.79 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3407  putative signal transduction protein  28.95 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3566  putative signal transduction protein  27.21 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3845  SH3 domain-containing protein  24.08 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000383374  hitchhiker  0.0000000226441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>