68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4197 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4197  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3852  SH3, type 3  34.03 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000664747  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0715  SH3 type 3 domain-containing protein  30.5 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000965232  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3845  SH3 domain-containing protein  34.46 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000383374  hitchhiker  0.0000000226441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0567  SH3 type 3 domain-containing protein  27.32 
 
 		 193 aa  97.8  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0915  SH3 type 3 domain-containing protein  32.76 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000529775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03714  SH3, type 3  29.59 
 
 		 258 aa  91.7  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000284257  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2675  SH3 domain-containing protein  29.07 
 
 		 200 aa  89  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000104931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3489  SH3 type 3 domain-containing protein  32.16 
 
 		 181 aa  89  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000200384  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0851  SH3 domain-containing protein  34.16 
 
 		 182 aa  87.8  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3566  putative signal transduction protein  33.5 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0616  SH3 domain-containing protein  29.15 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3407  putative signal transduction protein  33.5 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3121  SH3 domain-containing protein  32.93 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.278206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10220  SH3 domain-containing protein  29.53 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0933  hypothetical protein  29.53 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0797  putative signal transduction protein  31.28 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3772  hypothetical protein  30.34 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0690  SH3, type 3  27.75 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000176512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00861  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2021  hypothetical protein  32.66 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0905  SH3 type 3 domain protein  32.88 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000893023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3497  SH3-like region  30.57 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0881  SH3 type 3 domain-containing protein  32.88 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001426  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3098  SH3 type 3 domain-containing protein  33.93 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000537469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02875  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000049587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0644  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000398097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3518  putative signal transduction protein  29.27 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3232  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0645  SH3 domain protein  28.57 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.8262e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3348  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4367  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02925  predicted signal transduction protein (SH3 domain)  28.57 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000497007  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0820  SH3 type 3 domain-containing protein  30.54 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3457  SH3 type 3 domain-containing protein  32.19 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000152698  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3683  SH3 type 3 domain-containing protein  28.37 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2683  hypothetical protein  31.11 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0191282  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3463  putative signal transduction protein  29.31 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2333  SH3-like region  25.68 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0682642  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3457  putative signal transduction protein  29.31 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.262114 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3393  putative signal transduction protein  29.31 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3389  putative signal transduction protein  29.31 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0642  putative signal transduction protein  32.2 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000817142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0295  putative signal transduction protein  32.2 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.023009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3559  putative signal transduction protein  29.31 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.617319  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0561  putative signal transduction protein  32.2 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117264  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2285  SH3 type 3 domain-containing protein  28.29 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150232  normal  0.248949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3631  hypothetical protein  28.02 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0330275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2102  SH3 type 3 domain-containing protein  28.02 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.106073  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1910  hypothetical protein  28.5 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00493464  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4292  putative signal transduction protein  35.06 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000541961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0831  putative signal transduction protein  31.13 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2369  SH3 type 3 domain-containing protein  26.7 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3458  putative signal transduction protein  28.98 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000279998  normal  0.164628 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2532  hypothetical protein  24.75 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0365  hypothetical protein  28.79 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.529008 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0179  SH3 type 3 domain-containing protein  29.61 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1192  hypothetical protein  26.8 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2044  hypothetical protein  22.94 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.74668  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0747  SH3 type 3 domain protein  22.4 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.737652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3097  SH3 type 3 domain-containing protein  29.02 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1504  SH3-like region  26.53 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1489  SH3 type 3 domain-containing protein  24.14 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023318  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1880  SH3 type 3 domain-containing protein  24.63 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3625  SH3 type 3 domain-containing protein  24.65 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000261951  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1715  SH3 domain-containing protein  21.78 
 
 		 245 aa  45.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0499  hypothetical protein  21.86 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2081  hypothetical protein  30.95 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>