67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0690 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0690  SH3, type 3  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000176512  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0567  SH3 type 3 domain-containing protein  52.85 
 
 		 193 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0616  SH3 domain-containing protein  47.8 
 
 		 182 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0915  SH3 type 3 domain-containing protein  46.99 
 
 		 183 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000529775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0715  SH3 type 3 domain-containing protein  43.46 
 
 		 191 aa  192  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000965232  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3845  SH3 domain-containing protein  45.3 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000383374  hitchhiker  0.0000000226441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3489  SH3 type 3 domain-containing protein  46.41 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000200384  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3098  SH3 type 3 domain-containing protein  46.15 
 
 		 182 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000537469  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0905  SH3 type 3 domain protein  47.4 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000893023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0851  SH3 domain-containing protein  42.31 
 
 		 182 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3121  SH3 domain-containing protein  42.86 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.278206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0820  SH3 type 3 domain-containing protein  41.76 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3772  hypothetical protein  40.66 
 
 		 182 aa  170  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0881  SH3 type 3 domain-containing protein  47.25 
 
 		 182 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001426  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3457  SH3 type 3 domain-containing protein  46.45 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000152698  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2675  SH3 domain-containing protein  34.78 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000104931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03714  SH3, type 3  35.67 
 
 		 258 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000284257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3852  SH3, type 3  34.48 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000664747  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2333  SH3-like region  30.3 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0682642  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2683  hypothetical protein  31.03 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0191282  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4197  hypothetical protein  27.23 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3566  putative signal transduction protein  31.85 
 
 		 206 aa  85.5  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00861  hypothetical protein  29.94 
 
 		 203 aa  85.1  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3407  putative signal transduction protein  31.21 
 
 		 206 aa  84.3  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3457  putative signal transduction protein  26.75 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.262114 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02925  predicted signal transduction protein (SH3 domain)  25.95 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000497007  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3232  putative signal transduction protein  25.95 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3518  putative signal transduction protein  25.95 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3463  putative signal transduction protein  26.75 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0644  putative signal transduction protein  25.95 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000398097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3348  putative signal transduction protein  25.95 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0645  SH3 domain protein  25.95 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.8262e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3389  putative signal transduction protein  26.75 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4367  putative signal transduction protein  25.95 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02875  hypothetical protein  25.95 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000049587  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3393  putative signal transduction protein  26.75 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3559  putative signal transduction protein  26.75 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.617319  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0295  putative signal transduction protein  30.19 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.023009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4292  putative signal transduction protein  28.3 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000541961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0561  putative signal transduction protein  29.56 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117264  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0642  putative signal transduction protein  29.56 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000817142  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0831  putative signal transduction protein  34.69 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0797  putative signal transduction protein  32.03 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2021  hypothetical protein  32.41 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3458  putative signal transduction protein  24.05 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000279998  normal  0.164628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2102  SH3 type 3 domain-containing protein  29.81 
 
 		 216 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.106073  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3631  hypothetical protein  29.81 
 
 		 216 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0330275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2285  SH3 type 3 domain-containing protein  29.56 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150232  normal  0.248949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2369  SH3 type 3 domain-containing protein  28.04 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0179  SH3 type 3 domain-containing protein  25.93 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0933  hypothetical protein  27.13 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10220  SH3 domain-containing protein  27.13 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1715  SH3 domain-containing protein  27.48 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1910  hypothetical protein  25.26 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00493464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3497  SH3-like region  25.42 
 
 		 276 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1880  SH3 type 3 domain-containing protein  28.05 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1192  hypothetical protein  33.67 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0499  hypothetical protein  25.73 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3683  SH3 type 3 domain-containing protein  24.14 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1504  SH3-like region  26.98 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3097  SH3 type 3 domain-containing protein  25.53 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0747  SH3 type 3 domain protein  27.97 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.737652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2532  hypothetical protein  25.62 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0365  hypothetical protein  23.26 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.529008 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1489  SH3 type 3 domain-containing protein  24.1 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023318  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2044  hypothetical protein  22.68 
 
 		 236 aa  45.1  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.74668  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2347  hypothetical protein  24.18 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>