More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1174 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1174  quinol oxidase, subunit II  100 
 
 
330 aa  658    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3838  quinol oxidase, subunit II  56.31 
 
 
332 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1227  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  53.66 
 
 
334 aa  349  4e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0219402  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2689  cytochrome bd-I oxidase subunit II  51.07 
 
 
337 aa  339  4e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00269242  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5233  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  53.03 
 
 
345 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.507916 
 
 
-
 
NC_003296  RS03187  putative transmembrane cytochrome bd-II oxidase (subunit II) oxidoreductase protein  52.42 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.337789  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2574  putative quinol oxidase subunit II transmembrane protein  51.99 
 
 
331 aa  323  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.364197  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4270  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  51.82 
 
 
343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.299048 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4158  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  51.82 
 
 
343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4116  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  48.79 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0737  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  49.24 
 
 
337 aa  312  3.9999999999999997e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0495  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  47.27 
 
 
343 aa  309  5e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03484  quinol oxidase, subunit II  51.38 
 
 
335 aa  297  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1695  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  41.32 
 
 
338 aa  224  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0476582  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1516  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  41.18 
 
 
338 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.475209  normal  0.900385 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0255  hypothetical protein  38.14 
 
 
329 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3152  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.62 
 
 
335 aa  222  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0091  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.39 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.243968  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0260  hypothetical protein  37.84 
 
 
329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2132  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.04 
 
 
336 aa  218  7.999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.19324  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3574  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.35 
 
 
335 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0902156 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4065  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40 
 
 
334 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508288  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0788  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.95 
 
 
335 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1267  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.36 
 
 
334 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3377  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.45 
 
 
335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3271  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.54 
 
 
335 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327803  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000388  putative Cytochrome bd2 subunit II  38.25 
 
 
335 aa  215  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4650  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.35 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1473  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.21 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3450  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.75 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4073  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.24 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.889217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4512  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.05 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595783  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2643  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.18 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4644  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.43 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39866  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3332  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.95 
 
 
335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0913  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.61 
 
 
335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0929  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.45 
 
 
335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4671  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.84 
 
 
334 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297118  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0942  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.91 
 
 
335 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1086  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.91 
 
 
335 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4956  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  40.91 
 
 
335 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.545349  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3833  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.04 
 
 
336 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4892  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  38.02 
 
 
335 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2426  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.05 
 
 
331 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154606  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1786  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 2  39.14 
 
 
334 aa  208  8e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.703016  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4379  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.69 
 
 
334 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5131  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.91 
 
 
336 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555192 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4647  cyanide-insensitive terminal oxidase CioB  37.16 
 
 
335 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3385  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  37.58 
 
 
338 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4142  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.25 
 
 
336 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1251  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.53 
 
 
347 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0192  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.18 
 
 
337 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2039  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40 
 
 
341 aa  206  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02215  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit II  40.12 
 
 
339 aa  206  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3857  hypothetical protein  39.45 
 
 
335 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.346842  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0963  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.84 
 
 
335 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.238614  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3131  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.39 
 
 
336 aa  205  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4281  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  37.65 
 
 
335 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.207239  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0927  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.54 
 
 
335 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.304728  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3951  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.72 
 
 
335 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13040  CioB, cyanide insensitive terminal oxidase  36.86 
 
 
335 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1178  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.86 
 
 
335 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0707  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II (cydB, qxtB)  38.3 
 
 
336 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1614  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.19 
 
 
328 aa  203  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4158  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.61 
 
 
337 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119875  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3592  Cytochrome bd type quinol oxidase subunit 2 protein  36.84 
 
 
334 aa  202  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4324  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.05 
 
 
334 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0747  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.61 
 
 
335 aa  202  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0702  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.06 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2591  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  35.61 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0713  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.06 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4100  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  36.47 
 
 
335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00146207  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3210  quinol oxidase subunit II QxtB  38.41 
 
 
335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3287  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  43.94 
 
 
337 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0675  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.06 
 
 
347 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.340894 
 
 
-
 
NC_003296  RS03150  putative transmembrane cytochrome bd-II oxidase (subunit II) oxidoreductase protein  35.45 
 
 
336 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73808  normal  0.0133752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5280  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.39 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0741  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.61 
 
 
340 aa  197  3e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0174  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  35.21 
 
 
337 aa  196  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.132519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1675  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  35.21 
 
 
337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.186324  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0561  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  38.81 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4285  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  38.34 
 
 
335 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000591698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2860  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.05 
 
 
335 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1026  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.45 
 
 
332 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0595  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.95 
 
 
336 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173418  normal  0.217419 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1766  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.71 
 
 
343 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11040  Cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  37.08 
 
 
335 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2000  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.72 
 
 
333 aa  192  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257779  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00094  ubiquinol oxidase subunit II, cyanide insensitive  38.62 
 
 
333 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0206  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  38.24 
 
 
341 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.390263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0417  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.06 
 
 
334 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3117  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.91 
 
 
334 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2528  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.76 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3926  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.7 
 
 
337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4928  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.75 
 
 
335 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000554234 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6969  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  38.21 
 
 
335 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5512  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.51 
 
 
337 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716831  normal  0.432807 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1965  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit II  37.06 
 
 
336 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448383  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0173  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  35.78 
 
 
337 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0403  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.06 
 
 
336 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>