More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0173 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0173  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  100 
 
 
337 aa  670    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4047  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  71.22 
 
 
337 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.275626  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0174  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  62.91 
 
 
337 aa  427  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.132519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1675  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  63.2 
 
 
337 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.186324  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2591  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  61.42 
 
 
337 aa  427  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3998  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  63.03 
 
 
339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000400193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0150  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  61.42 
 
 
337 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00578522 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1766  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  58.08 
 
 
343 aa  396  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3332  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.86 
 
 
335 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223334  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4671  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.79 
 
 
334 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297118  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0091  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  41.9 
 
 
338 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.243968  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4379  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  41.39 
 
 
334 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4324  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  41.96 
 
 
334 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3008  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.12 
 
 
343 aa  249  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3050  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.12 
 
 
343 aa  249  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000388  putative Cytochrome bd2 subunit II  40.62 
 
 
335 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5280  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.88 
 
 
334 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1267  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.11 
 
 
334 aa  245  9e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0192  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.16 
 
 
337 aa  245  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4073  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.23 
 
 
336 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.889217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3574  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.36 
 
 
335 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0902156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4928  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.25 
 
 
335 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000554234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0929  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.06 
 
 
335 aa  236  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2132  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.88 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.19324  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3450  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.06 
 
 
335 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0963  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.86 
 
 
335 aa  235  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.238614  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2426  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.88 
 
 
331 aa  235  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154606  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3131  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.72 
 
 
336 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0707  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II (cydB, qxtB)  39.51 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3377  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.06 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0927  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.86 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.304728  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0913  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.76 
 
 
335 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3857  hypothetical protein  41.1 
 
 
335 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.346842  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4644  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.7 
 
 
335 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39866  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4650  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.02 
 
 
335 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1178  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.06 
 
 
335 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4011  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  41.07 
 
 
334 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13040  CioB, cyanide insensitive terminal oxidase  40.06 
 
 
335 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4142  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.74 
 
 
336 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1026  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.21 
 
 
332 aa  229  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4512  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.72 
 
 
335 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595783  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0170  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.43 
 
 
334 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1251  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.55 
 
 
347 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0788  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.41 
 
 
335 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3385  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  39.08 
 
 
338 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3833  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.44 
 
 
336 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3592  Cytochrome bd type quinol oxidase subunit 2 protein  39.88 
 
 
334 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5131  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.99 
 
 
336 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4065  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.58 
 
 
334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508288  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3152  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.27 
 
 
335 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02215  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit II  35.82 
 
 
339 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4647  cyanide-insensitive terminal oxidase CioB  39.02 
 
 
335 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4281  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  39.02 
 
 
335 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.207239  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1695  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.69 
 
 
338 aa  223  4e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0476582  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1516  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  37.39 
 
 
338 aa  222  8e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.475209  normal  0.900385 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0942  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.48 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1086  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.48 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3951  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.96 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5725  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.41 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31475  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0417  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.76 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3839  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  37.85 
 
 
335 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.425133  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3271  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.5 
 
 
335 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327803  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0255  hypothetical protein  34.55 
 
 
329 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03150  putative transmembrane cytochrome bd-II oxidase (subunit II) oxidoreductase protein  36.76 
 
 
336 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73808  normal  0.0133752 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6191  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.08 
 
 
335 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1786  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 2  40.19 
 
 
334 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.703016  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2643  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.84 
 
 
335 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5696  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.24 
 
 
329 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.188529 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0675  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.57 
 
 
347 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.340894 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0260  hypothetical protein  34.55 
 
 
329 aa  217  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4892  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  37.88 
 
 
335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5401  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.31 
 
 
335 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.117755  normal  0.0278093 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1464  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.04 
 
 
333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.663367  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0702  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.96 
 
 
347 aa  215  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0713  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.96 
 
 
347 aa  215  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3210  quinol oxidase subunit II QxtB  39.26 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7067  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.42 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660644  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2860  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.85 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2039  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.37 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1421  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.5 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6408  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.5 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6442  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.12 
 
 
335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.42498 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6969  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  36.5 
 
 
335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4819  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.63 
 
 
335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1473  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.25 
 
 
335 aa  212  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5233  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  38.73 
 
 
345 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.507916 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5366  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.32 
 
 
335 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5684  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.81 
 
 
335 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3926  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.62 
 
 
337 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2574  putative quinol oxidase subunit II transmembrane protein  36.73 
 
 
331 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.364197  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2419  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.92 
 
 
331 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.121769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2528  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36 
 
 
335 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11040  Cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  38.15 
 
 
335 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0561  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  37.16 
 
 
333 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5382  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.32 
 
 
335 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000808  putative Cytochrome bd2 subunit II  37.35 
 
 
332 aa  209  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5479  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.32 
 
 
335 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0779913  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4790  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.32 
 
 
335 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4100  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  38.77 
 
 
335 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00146207  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0174  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  39.63 
 
 
335 aa  208  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>