More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3720 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3720  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
336 aa  667    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4781  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.59 
 
 
334 aa  298  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2443  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  51.04 
 
 
340 aa  256  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2001  cysteine synthase  32.3 
 
 
375 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2157  cysteine synthase  32.3 
 
 
375 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2508  cysteine synthase  30.54 
 
 
354 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2561  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  30.18 
 
 
354 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1397  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  30.18 
 
 
354 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2123  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  30.18 
 
 
354 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2021  cysteine synthase  32.3 
 
 
375 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1621  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  30.24 
 
 
336 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2647  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  30.24 
 
 
336 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55558  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3191  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  30.24 
 
 
336 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921178  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1970  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  30.24 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7479  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.54 
 
 
547 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2436  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  29.6 
 
 
344 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0655  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.57 
 
 
335 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766039  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10865  cysteine synthase A cysK2  28.26 
 
 
372 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5856  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.41 
 
 
368 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.977841  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4560  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  26.61 
 
 
393 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4197  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.08 
 
 
369 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4263  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.08 
 
 
369 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651474  normal  0.919062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4424  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.08 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1444  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.1 
 
 
371 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1462  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.1 
 
 
371 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.867609  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1117  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, subunit beta  31.52 
 
 
341 aa  84  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000129584  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4971  Cysteine synthase-like protein  27.74 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0417  cysteine synthase A protein  32.84 
 
 
338 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0440499  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0899  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.53 
 
 
371 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  29.74 
 
 
388 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  30.4 
 
 
756 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1337  cysteine synthase A  29.37 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241539  normal  0.869018 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  28.36 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1863  cysteine synthase  30.32 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2603  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.68 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908423  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  28.08 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6948  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.36 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1790  cysteine synthase  26.36 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.475157  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11413  putative cysteine synthase  26.1 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63655  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0103  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  26.2 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000135752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0107  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.2 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000822794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  27.42 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4585  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.56 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7558  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  25.8 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3877  Cysteine synthase  32.73 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0366  cysteine synthase  30.91 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  26.28 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  26.28 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2310  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.4 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  25.33 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1207  cysteine synthase  24.55 
 
 
322 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243759  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  28.88 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  26.87 
 
 
459 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  27.5 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3903  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.17 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  29.01 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0024  cysteine synthase A  25.89 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  27.74 
 
 
320 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  27.04 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0590  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.74 
 
 
336 aa  63.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  28.31 
 
 
308 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  27.21 
 
 
302 aa  63.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  26.49 
 
 
454 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  28.46 
 
 
455 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  28.21 
 
 
455 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  25.64 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  25.74 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0783  cysteine synthase A  26.97 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  24.11 
 
 
453 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  28.42 
 
 
456 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1152  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.21 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1113  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  28.65 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  27.93 
 
 
707 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4300  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.65 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589302  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  23.79 
 
 
459 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  27.02 
 
 
304 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0369  cysteine synthase  27.2 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.425105  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  27.1 
 
 
320 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  28.62 
 
 
307 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  28.86 
 
 
469 aa  60.5  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.09 
 
 
307 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0633  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (Thiol)-lyase) (CSase)  29.06 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.343914  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.6 
 
 
459 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.6 
 
 
459 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2304  cysteine synthase  22.91 
 
 
310 aa  60.1  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  26.82 
 
 
354 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3752  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (thiol)-lyase) (CSase)  27.56 
 
 
351 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0264452  normal  0.188869 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2140  cysteine synthase A  24.6 
 
 
342 aa  59.7  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1583  cysteine synthase K/M:cysteine synthase A  26.8 
 
 
324 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.615929  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.14 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  26.28 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3684  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.06 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  25.19 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004156  cysteine synthase  25.26 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000187133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  26.24 
 
 
459 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  27.16 
 
 
462 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  28.15 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  23.45 
 
 
461 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29110  cysteine synthase A  26.12 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  25.45 
 
 
305 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>