More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4781 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4781  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
334 aa  674    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2443  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  69.49 
 
 
340 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3720  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  55.69 
 
 
336 aa  335  5.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1970  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  34.77 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2508  cysteine synthase  33.63 
 
 
354 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2157  cysteine synthase  33.83 
 
 
375 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2001  cysteine synthase  33.83 
 
 
375 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1397  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  34.04 
 
 
354 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2021  cysteine synthase  33.83 
 
 
375 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2123  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  34.04 
 
 
354 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2561  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  34.04 
 
 
354 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1621  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  33.85 
 
 
336 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3191  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  33.85 
 
 
336 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921178  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2647  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  33.85 
 
 
336 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55558  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7479  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.28 
 
 
547 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2436  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  30.72 
 
 
344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0655  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.32 
 
 
335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4971  Cysteine synthase-like protein  31.32 
 
 
379 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1444  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.72 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1462  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.72 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.867609  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4197  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.94 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4263  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.94 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651474  normal  0.919062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5856  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.2 
 
 
368 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.977841  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10865  cysteine synthase A cysK2  29.9 
 
 
372 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109257 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4424  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.57 
 
 
369 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4560  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.43 
 
 
393 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0899  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.72 
 
 
371 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.92 
 
 
459 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2603  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.74 
 
 
378 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  29.67 
 
 
388 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  27.48 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  27.48 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  27.48 
 
 
310 aa  92.4  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  28.26 
 
 
324 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3958  cysteine synthase A  28.1 
 
 
332 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  28.57 
 
 
302 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  28.57 
 
 
331 aa  89.4  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.52 
 
 
459 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.52 
 
 
459 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5010  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.27 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278031  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  26.2 
 
 
459 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  26.03 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  28.1 
 
 
338 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2564  cysteine synthase A  26.62 
 
 
345 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.544676  normal  0.832918 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.68 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  31.08 
 
 
301 aa  85.9  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  24.62 
 
 
309 aa  85.9  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  27.01 
 
 
324 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  26.44 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  27.73 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4559  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.27 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  23.08 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  23.41 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1117  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, subunit beta  30.3 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000129584  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1424  cysteine synthase A  27.44 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348736  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2553  cysteine synthase A  25.8 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0093457  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2837  cysteine synthase A  26.43 
 
 
345 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3752  putative cysteine synthase (O-acetylserine sulfhydrylase) (O-acetylserine (thiol)-lyase) (CSase)  30.48 
 
 
351 aa  82.4  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0264452  normal  0.188869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1207  cysteine synthase  23.26 
 
 
322 aa  82.4  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243759  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  24.02 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  25.77 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2907  cysteine synthase A  26.43 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156329  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  26.15 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  27.89 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  29.55 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.45 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.816329  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.45 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2304  cysteine synthase  24.55 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4585  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.68 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7558  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  22.55 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.43 
 
 
302 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  27.27 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  25.37 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  29.84 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2310  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.57 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.61 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  21.32 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  27.8 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29160  cysteine synthase  26.87 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  27.01 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  27.27 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0417  cysteine synthase A protein  28.13 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0440499  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  27.63 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  26.55 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  23.95 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  26.28 
 
 
707 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  23.83 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  23.83 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  23.83 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  23.83 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  23.83 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  28.12 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  27.86 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0590  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  26.72 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3877  Cysteine synthase  30.69 
 
 
338 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1534  cysteine synthase A  26.09 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  27.74 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1439  cysteine synthase A  26.71 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159205  normal  0.177571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1863  cysteine synthase  28.73 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  27.38 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>