More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2779 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2779  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  1034    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1244  hypothetical protein  51.55 
 
 
514 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.635115 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2018  MCP methyltransferase, CheR-type  38.12 
 
 
865 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854917  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2080  MCP methyltransferase, CheR-type  37.03 
 
 
825 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646014  normal  0.992336 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05314  conserved hypothetical protein  32.93 
 
 
529 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01637  Molybdenum cofactor sulfurase (MoCo sulfurase)(MOS)(EC 4.4.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9UV64]  29.55 
 
 
839 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46641  predicted protein  28.74 
 
 
1036 aa  164  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  26.21 
 
 
428 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.82 
 
 
421 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.32 
 
 
415 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.97 
 
 
417 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.63 
 
 
413 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.63 
 
 
413 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  26.02 
 
 
452 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.95 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.34 
 
 
409 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  29.81 
 
 
429 aa  97.8  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.9 
 
 
412 aa  97.4  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.91 
 
 
420 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.68 
 
 
428 aa  96.7  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  29.62 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.15 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  28.57 
 
 
421 aa  95.9  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  24.94 
 
 
428 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.41 
 
 
414 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  26.19 
 
 
408 aa  95.1  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.57 
 
 
418 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  27.86 
 
 
423 aa  94  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25 
 
 
414 aa  93.2  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.3 
 
 
414 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.74 
 
 
414 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  26.26 
 
 
403 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.27 
 
 
406 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.17 
 
 
419 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  23.81 
 
 
442 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.8 
 
 
442 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.22 
 
 
441 aa  90.1  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.27 
 
 
443 aa  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.77 
 
 
885 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.91 
 
 
413 aa  89.7  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.08 
 
 
414 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  27.54 
 
 
406 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.54 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.54 
 
 
406 aa  89  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  26.25 
 
 
420 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  27.54 
 
 
406 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25 
 
 
419 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  26.73 
 
 
417 aa  89.4  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.12 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  28.14 
 
 
383 aa  88.2  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.77 
 
 
419 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.48 
 
 
406 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.1 
 
 
425 aa  87.4  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.54 
 
 
406 aa  87  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.49 
 
 
406 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.49 
 
 
406 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.49 
 
 
406 aa  86.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  28.78 
 
 
424 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0268  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.23 
 
 
399 aa  86.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.94 
 
 
414 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.96 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  26.96 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.17 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.59 
 
 
435 aa  85.9  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.62 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.17 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0386  cysteine desulfurase, SufS family protein  26.83 
 
 
452 aa  84.7  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.559739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0273  aminotransferase class V  28.18 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.06 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.37 
 
 
417 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.86 
 
 
421 aa  84.7  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  25.8 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.37 
 
 
417 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.94 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  22.99 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  29.62 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.9 
 
 
449 aa  84  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  26.91 
 
 
441 aa  84  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  26.05 
 
 
413 aa  84  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.62 
 
 
429 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  25.12 
 
 
472 aa  83.6  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  26.72 
 
 
878 aa  83.6  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.65 
 
 
417 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.95 
 
 
630 aa  83.2  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.62 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  25.31 
 
 
380 aa  83.2  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.18 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  22.99 
 
 
386 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0967  cysteine desulfurase, aminotransferase, class V  29.18 
 
 
399 aa  83.2  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.19 
 
 
406 aa  82.8  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  25.07 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  26.38 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  28.21 
 
 
425 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.67 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.02 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.87 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  26.35 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  28.1 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.95 
 
 
679 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  27.1 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.674845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>