More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1095 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  100 
 
 		 252 aa  485  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  61.32 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  54.73 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  53.57 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  51.24 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  47.56 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  45.87 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  48.32 
 
 		 263 aa  171  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  51.05 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  49.54 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  45.5 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  50.63 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  40.86 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  46.01 
 
 		 270 aa  135  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25080  methyltransferase family protein  41.06 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.779034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  29.67 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  29.92 
 
 		 261 aa  94.4  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  29.08 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  29.92 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  29.92 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  30.36 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  26.46 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  28 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  27.6 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.6 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  27.6 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  27.6 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  27.6 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  27.6 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  30.61 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  27.6 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  27.6 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  30.68 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  27.13 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  29.53 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  29.53 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  29.53 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  29.53 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  29.53 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  25.9 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  31.33 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  23.55 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  23.55 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  29.44 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  27.65 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  29.84 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  23.64 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  24.52 
 
 		 271 aa  72  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  26.69 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  29.84 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  29.03 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  25.58 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  25.98 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  31.16 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  25.59 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  25.38 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  25.91 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  29.03 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  26.61 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  28.64 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  24.7 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.07 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  25.2 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  29.84 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  29.44 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0087  SAM-dependent methyltransferase  24.47 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  22.75 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  26.03 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.33 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.04 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.65 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  24.49 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.61 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  32.1 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0179  hypothetical protein  22.98 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.36 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  32.2 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  33.66 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5288  Methyltransferase type 11  25.43 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115739  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  29.91 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.81 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  47.46 
 
 		 225 aa  53.9  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.74 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.68 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.43 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  36.43 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.13 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 283 aa  52  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>