111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01900 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 247 aa  512  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  39.53 
 
 		 278 aa  182  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  38.28 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  38.34 
 
 		 261 aa  181  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  37.8 
 
 		 261 aa  180  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  37.6 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  37.6 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  39.13 
 
 		 261 aa  178  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  37.2 
 
 		 261 aa  178  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  37.15 
 
 		 261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.15 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  37.15 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  37.15 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  37.15 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  37.15 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  37.15 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  37.15 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  37.15 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 262 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 262 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  36.8 
 
 		 260 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 261 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  37.5 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  35.74 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  35.74 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  35.74 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  35.74 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  35.74 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  36 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  34.8 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  35.47 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  35.83 
 
 		 259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  36 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  34.65 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  35.83 
 
 		 256 aa  154  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  34.11 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  33.72 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  34.11 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  36.08 
 
 		 268 aa  145  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  34.29 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  33.47 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 249 aa  136  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  34.41 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 295 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 252 aa  135  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  29.5 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  33.6 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  32.24 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  33.47 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  29.12 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  32.65 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  29.88 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  31.8 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  28.52 
 
 		 262 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  28.81 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  30 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  26.22 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  25.82 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  24.71 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  34.67 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  34.67 
 
 		 248 aa  52  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  25.76 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  26.63 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  26.4 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  22.95 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.74 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  23.39 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 241 aa  45.4  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.01 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.98 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.01 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  28.39 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.1 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.49 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.01 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  23.76 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  20.83 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.46 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.71 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.2 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  30.89 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.12 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>