More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2165 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  100 
 
 
269 aa  535  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  43.36 
 
 
268 aa  151  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  29.96 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  29.96 
 
 
267 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  29.96 
 
 
267 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  29.96 
 
 
267 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  29.55 
 
 
267 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  28.63 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.98 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  28.98 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  28.98 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  28.98 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  28.98 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  28.98 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  28.98 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  28.98 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  28.57 
 
 
261 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  35.75 
 
 
252 aa  88.6  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  28.98 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  28.57 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  29.5 
 
 
262 aa  85.9  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  29.5 
 
 
262 aa  85.9  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  29.49 
 
 
263 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  28.28 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  28.24 
 
 
261 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  29.63 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  33.61 
 
 
263 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  34.86 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  28.44 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  30.2 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  28.51 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  26.64 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  31.22 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  29.72 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  26.01 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  26.15 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  26.15 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  27.03 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  26.25 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  26.64 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  25.69 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0087  SAM-dependent methyltransferase  24.4 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  26.36 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  24.7 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  24.41 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  26.42 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  34 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  33.09 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  38.19 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  27.27 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  25.85 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  31.66 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  32 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
252 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  30.98 
 
 
268 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  32 
 
 
248 aa  62.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0179  hypothetical protein  23.95 
 
 
238 aa  62.4  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  39.09 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.79 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  37.31 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  24.71 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  30.88 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  32.45 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  42.98 
 
 
252 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  34.48 
 
 
246 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.17 
 
 
232 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 
225 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  26.5 
 
 
295 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.44 
 
 
247 aa  56.2  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  33.78 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.3 
 
 
232 aa  55.5  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
226 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  25.51 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 
262 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.33 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.65 
 
 
253 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  40 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  30.07 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.17 
 
 
232 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.17 
 
 
232 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.17 
 
 
232 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  39.42 
 
 
252 aa  53.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.7 
 
 
447 aa  53.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  37.27 
 
 
249 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  38.18 
 
 
249 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  34.91 
 
 
249 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.53 
 
 
246 aa  52.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
249 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
234 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  30.63 
 
 
247 aa  52.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.17 
 
 
232 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.5 
 
 
229 aa  52.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  34.91 
 
 
249 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.9 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0134  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.65 
 
 
253 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200688  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.84 
 
 
252 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  31.52 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
309 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>