264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0730 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  100 
 
 		 259 aa  537  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  73.26 
 
 		 263 aa  408  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  74.03 
 
 		 263 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  68.34 
 
 		 260 aa  387  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  56.55 
 
 		 271 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  49.42 
 
 		 278 aa  267  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  48.05 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  48.05 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  48.05 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  48.05 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  48.05 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  48.05 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  48.05 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  48.05 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  48.05 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  49.41 
 
 		 258 aa  262  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  48.03 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  48.03 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  47.49 
 
 		 261 aa  258  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  46.48 
 
 		 261 aa  258  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  47.64 
 
 		 261 aa  258  8e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  48.03 
 
 		 267 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  47.64 
 
 		 267 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  47.64 
 
 		 267 aa  254  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  46.09 
 
 		 261 aa  254  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  47.64 
 
 		 267 aa  254  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  47.64 
 
 		 267 aa  254  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  47.66 
 
 		 261 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  41.43 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 262 aa  204  8e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 262 aa  204  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  39.04 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 257 aa  198  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  39.04 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  39.04 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  39.04 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  40.48 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  39.06 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  39.46 
 
 		 259 aa  191  8e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  39.22 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  35.83 
 
 		 247 aa  165  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  36.33 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  34.4 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  36.43 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  32.68 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  34.87 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  33.73 
 
 		 249 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  32.8 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  34.47 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  32.55 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  32.95 
 
 		 249 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  32.95 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  37.36 
 
 		 199 aa  123  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  31.25 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  25.65 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  24.69 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  29.63 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  23.4 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  22.22 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  22.4 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  26.1 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  24.7 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  23.72 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.89 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  23.41 
 
 		 237 aa  62  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  21.74 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  24.51 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  22.67 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.51 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.84 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  23.17 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  32.12 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  25.33 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.83 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_42302  predicted protein  30.58 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  21.95 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.61 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.45 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.26 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.22 
 
 		 240 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.91 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.36 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  24.89 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  43.14 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.22 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  25.41 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.22 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.6 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.36 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>