More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2177 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  100 
 
 		 252 aa  528  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  42.11 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  40 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  42.29 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  38.4 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  38.4 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  38.4 
 
 		 267 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  40.64 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  40.64 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  38.4 
 
 		 267 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  40.23 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  38.4 
 
 		 267 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  40 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  38.96 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.19 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  38.19 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  38.19 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  38.19 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  38.19 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  38.19 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  38.19 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  38.19 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  38.19 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  39.13 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  38.74 
 
 		 278 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  37.74 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  38.13 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  36.58 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  36.22 
 
 		 261 aa  161  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  36.33 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  38.43 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  33.33 
 
 		 271 aa  158  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  37.05 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  37.05 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  37.05 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  35.66 
 
 		 263 aa  154  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  34.51 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  36.08 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  34.88 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  34.14 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  34.01 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  33.6 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  34.82 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  34.82 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  32.43 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  33.47 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  32.79 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  34.27 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  32.94 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  34.01 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  30.45 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  29.59 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  32.58 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  31.67 
 
 		 199 aa  90.9  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  27.54 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  27.53 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  24.7 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  25.7 
 
 		 270 aa  62  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  23.96 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  27.59 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  25.98 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2608  hypothetical protein  28.92 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000306401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 996 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.4 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  28.99 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  25.15 
 
 		 242 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.54 
 
 		 239 aa  52.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  25.75 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  32.63 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.25 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  25.75 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  22.5 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  25.75 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  23.7 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2413  hypothetical protein  27.71 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00295431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2333  methyltransferase  28.31 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0767046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2590  hypothetical protein  27.71 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  33.88 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.66 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.97 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  33.03 
 
 		 780 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  23.95 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 330 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  36.46 
 
 		 414 aa  49.7  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 229 aa  50.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  25.89 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>