113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3304 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3304  IMP dehydrogenase  100 
 
 
124 aa  246  6e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  83.19 
 
 
387 aa  200  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0372  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  83.19 
 
 
387 aa  200  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2653  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  80.67 
 
 
387 aa  196  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1831  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  76.67 
 
 
387 aa  191  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0836682 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1873  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  80.17 
 
 
384 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3501  IMP dehydrogenase family protein  78.15 
 
 
387 aa  192  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1944  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.83 
 
 
387 aa  180  7e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0721  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.83 
 
 
387 aa  179  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4230  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  73.11 
 
 
391 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403916 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0690  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.75 
 
 
387 aa  173  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15241  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.75 
 
 
387 aa  173  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09131  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.87 
 
 
388 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11521  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.91 
 
 
433 aa  164  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11671  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  62.18 
 
 
387 aa  157  3e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.83783  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11281  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.03 
 
 
387 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1073  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  59.66 
 
 
387 aa  153  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0630068  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  58.82 
 
 
387 aa  151  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.819706  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0815  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.94 
 
 
386 aa  138  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124541  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1874  IMP dehydrogenase family protein  50.42 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  decreased coverage  0.00497597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0624  IMP dehydrogenase family protein  47.01 
 
 
372 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2584  IMP dehydrogenase family protein  47.06 
 
 
374 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359176  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3640  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  44.92 
 
 
368 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0743  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.34 
 
 
373 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148651  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0459  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.61 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.490443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3053  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.61 
 
 
374 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28640  IMP dehydrogenase family protein  46.61 
 
 
374 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  42.74 
 
 
372 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1013  IMP dehydrogenase family protein  42.37 
 
 
369 aa  107  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0689  IMP dehydrogenase family protein  43.22 
 
 
374 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.525708  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0399  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.83 
 
 
374 aa  105  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0164551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4252  IMP dehydrogenase family protein  42.74 
 
 
372 aa  103  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4022  IMP dehydrogenase family protein  44.44 
 
 
370 aa  103  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0575021  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.21 
 
 
381 aa  103  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000405165  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_328  IMP dehydrogenase protein  47.32 
 
 
381 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000257669  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0384  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  47.32 
 
 
381 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000205726  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2595  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  43.59 
 
 
370 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0367  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  41.18 
 
 
369 aa  101  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.611854 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0814  IMP dehydrogenase family protein  41.53 
 
 
376 aa  101  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16500  IMP dehydrogenase family protein  41.27 
 
 
378 aa  100  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.347452  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4226  IMP dehydrogenase family protein  36.84 
 
 
387 aa  97.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4446  IMP dehydrogenase family protein  38.66 
 
 
383 aa  96.7  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5997  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.37 
 
 
376 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07610  IMP dehydrogenase family protein  38.98 
 
 
373 aa  95.1  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.77961  normal  0.235896 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04750  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.34 
 
 
377 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0641  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.61 
 
 
381 aa  87.8  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520073  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2581  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.46 
 
 
378 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6534  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  40 
 
 
377 aa  84  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2874  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  44.88 
 
 
378 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00446551  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08740  IMP dehydrogenase family protein  40.34 
 
 
369 aa  81.3  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1247  IMP dehydrogenase family protein  34.38 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.286643  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1727  IMP dehydrogenase family protein  35.25 
 
 
385 aa  78.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1512  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  33.61 
 
 
378 aa  77.4  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33643  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3836  IMP dehydrogenase family protein  35.34 
 
 
387 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1092  IMP dehydrogenase family protein  38 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0637  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  33.61 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0907  IMP dehydrogenase family protein  33.6 
 
 
388 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4908  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.07 
 
 
382 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1168  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  33.61 
 
 
378 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.670905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1185  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  33.61 
 
 
378 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1195  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36 
 
 
378 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13444  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.89 
 
 
375 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0996238  normal  0.0971856 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1545  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.82 
 
 
496 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.308364  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1138  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.33 
 
 
500 aa  51.2  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0819  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.82 
 
 
500 aa  50.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319462  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1132  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.82 
 
 
500 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.41509  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.43 
 
 
498 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.01 
 
 
498 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.36 
 
 
482 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.717892  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.88 
 
 
484 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1982  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.36 
 
 
482 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.311927  normal  0.313546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.08 
 
 
495 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1197  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.3 
 
 
491 aa  45.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.62 
 
 
497 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1194  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.94 
 
 
499 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0718304  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1992  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.88 
 
 
493 aa  43.9  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.369153  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.82 
 
 
496 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.43 
 
 
493 aa  43.9  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0694637  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.7 
 
 
500 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151769  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.09 
 
 
489 aa  43.5  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.78 
 
 
482 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1589  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
485 aa  42.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1670  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.87 
 
 
485 aa  42.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0531396  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.85 
 
 
498 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.68 
 
 
485 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0405  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.77 
 
 
485 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0548973 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0225  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.43 
 
 
493 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.85 
 
 
486 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.67 
 
 
498 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0737a  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.43 
 
 
487 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.82 
 
 
496 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0467  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.11 
 
 
500 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004341  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.43 
 
 
488 aa  41.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1261  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.43 
 
 
489 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4588  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.43 
 
 
489 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.43 
 
 
489 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.99 
 
 
489 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.43 
 
 
489 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01076  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.43 
 
 
487 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
486 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>