More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1247 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1247  IMP dehydrogenase family protein  100 
 
 
375 aa  741    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.286643  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6534  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  65.86 
 
 
377 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04750  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  64.08 
 
 
377 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1512  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.17 
 
 
378 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33643  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4446  IMP dehydrogenase family protein  62.53 
 
 
383 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1727  IMP dehydrogenase family protein  61.58 
 
 
385 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594141  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4226  IMP dehydrogenase family protein  59.32 
 
 
387 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1195  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.37 
 
 
378 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0624  IMP dehydrogenase family protein  56.84 
 
 
372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  55.5 
 
 
372 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13444  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  63.17 
 
 
375 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0996238  normal  0.0971856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1168  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  62.83 
 
 
378 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.670905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1185  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  62.83 
 
 
378 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2595  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.96 
 
 
370 aa  398  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3836  IMP dehydrogenase family protein  59.06 
 
 
387 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4022  IMP dehydrogenase family protein  55.23 
 
 
370 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0575021  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0907  IMP dehydrogenase family protein  60.47 
 
 
388 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4908  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  62.77 
 
 
382 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0399  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.96 
 
 
374 aa  387  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0164551  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0689  IMP dehydrogenase family protein  54.99 
 
 
374 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.525708  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16500  IMP dehydrogenase family protein  53.35 
 
 
378 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.347452  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0743  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  56.84 
 
 
373 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148651  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4252  IMP dehydrogenase family protein  55.23 
 
 
372 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0814  IMP dehydrogenase family protein  51.62 
 
 
376 aa  377  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07610  IMP dehydrogenase family protein  53.12 
 
 
373 aa  375  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.77961  normal  0.235896 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0367  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.64 
 
 
369 aa  372  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.611854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28640  IMP dehydrogenase family protein  53.91 
 
 
374 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3640  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.69 
 
 
368 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1013  IMP dehydrogenase family protein  51.47 
 
 
369 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3053  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.18 
 
 
374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2584  IMP dehydrogenase family protein  52.83 
 
 
374 aa  352  5e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359176  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1092  IMP dehydrogenase family protein  56.42 
 
 
352 aa  348  6e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2581  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.69 
 
 
378 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2874  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  54.96 
 
 
378 aa  346  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00446551  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08740  IMP dehydrogenase family protein  53.93 
 
 
369 aa  343  4e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0641  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.91 
 
 
381 aa  337  2.9999999999999997e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520073  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5997  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.92 
 
 
376 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0459  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.94 
 
 
387 aa  322  5e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.490443  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0637  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.33 
 
 
376 aa  319  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1874  IMP dehydrogenase family protein  49.73 
 
 
396 aa  304  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  decreased coverage  0.00497597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0815  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  48.39 
 
 
386 aa  291  9e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124541  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11521  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.63 
 
 
433 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11671  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.63 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.83783  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1831  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  40.75 
 
 
387 aa  272  6e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0836682 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_328  IMP dehydrogenase protein  39.73 
 
 
381 aa  272  6e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000257669  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.84 
 
 
387 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.819706  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0384  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.18 
 
 
381 aa  272  9e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000205726  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.18 
 
 
381 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000405165  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1073  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.02 
 
 
387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0630068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2653  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  41.13 
 
 
387 aa  262  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4230  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  43.01 
 
 
391 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403916 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3501  IMP dehydrogenase family protein  40.86 
 
 
387 aa  257  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15241  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.83 
 
 
387 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0690  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.83 
 
 
387 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11281  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.56 
 
 
387 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09131  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.57 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1873  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  40.65 
 
 
384 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0372  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  40.32 
 
 
387 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  40.32 
 
 
387 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1944  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  40.05 
 
 
387 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0721  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.25 
 
 
387 aa  242  7.999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3306  IMP dehydrogenase subunit  50.53 
 
 
219 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094959 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30 
 
 
485 aa  83.2  0.000000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.35 
 
 
486 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  23.27 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3304  IMP dehydrogenase  34.38 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.71 
 
 
487 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.85 
 
 
490 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  25.57 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.65 
 
 
483 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.64 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl343  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  25.85 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000535493  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  26.05 
 
 
483 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.68 
 
 
485 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3596  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.64 
 
 
487 aa  73.2  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000202307  normal  0.660698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.49 
 
 
556 aa  73.2  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  42.61 
 
 
488 aa  72.8  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.57 
 
 
486 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.64 
 
 
498 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.1 
 
 
486 aa  72  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  32.29 
 
 
484 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.82 
 
 
483 aa  71.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.05 
 
 
498 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.91 
 
 
508 aa  71.2  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.51 
 
 
486 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
495 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.15 
 
 
482 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.66 
 
 
485 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.82 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587091  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.49 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.67 
 
 
496 aa  70.5  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.08 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.8 
 
 
497 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1175  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.78 
 
 
489 aa  70.5  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.654831  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.22 
 
 
498 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0366  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.33 
 
 
516 aa  70.5  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.213754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.44 
 
 
487 aa  70.1  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0448  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.86 
 
 
488 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0437  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.86 
 
 
488 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1949  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.54 
 
 
485 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>